Lors de la réalisation d’un examen cytobactériologique des urines (ECBU), un délai de 48h est requis avant d’obtenir l’identification, la numération de la culture ainsi que l’antibiogramme de la bactérie mise en cause lors de l’infection urinaire. Dans le contexte actuel de l’augmentation des bactéries multi-résistantes, le profil de résistance des entérobactéries devient imprévisible, aussi bien en communautaire qu’en milieu hospitalier. Il apparaît donc intéressant de réduire ce délai de 48h à 8h afin d’adapter plus rapidement l’antibiothérapie probabiliste et d’éviter les échecs thérapeutiques.

Cette étude prospective a été réalisée entre août 2016 et janvier 2017. 158 échantillons d’urines ont été sélectionnés sur les critères suivants : franche leucocyturie>50 leucocytes/mm³ et présence de seuls bacilles à Gram négatif à l’examen direct. Les échantillons ont été traités selon deux méthodes : la méthode de référence (48h) consistait à ensemencer une gélose chromogène et réalisation d’un antibiogramme en milieu Mueller Hinton (MH incubé 20h, Biorad). La méthode rapide (8h) consistait à ensemencer directement un antibiogramme en milieu MHR (MH rapide, i2a, incubé 6 à 8h). Un panel de 22 antibiotiques a été testé, les diamètres d’inhibition ont été lus par le système SIRscan 2000 Automatic (i2a) et ont été interprétés selon les recommandations EUCAST 2016. Pour chaque bactérie et chaque antibiotique testés, nous avons comparé la concordance des interprétations entre les deux méthodes : sensible (S), intermédiaire (I) ou résistant (R).

Les 158 souches d’entérobactéries étaient distribuées entre 119 (75 %) Escherichia Coli et 39 (25 %) autres entérobactéries. Sur les 3246 tests réalisés, les résultats montraient 3167 (97,6 %) concordances, 47 (1,4 %) différences mineures (dm), 13 (0,4 %) différences majeures (DM) et 19 (0,6 %) différences très majeures (DTM). Les DTM constatées ont été principalement observées autour de la céfalexine et de la témocilline. Les DM concernaient principalement l’amoxicilline-acide clavulanique en considérant comme diamètres critiques 19–19mm, sans différenciation d’une infection urinaire haute ou basse.

Les résultats de notre étude montrent une bonne corrélation entre les résultats des antibiogrammes obtenus directement à partir de l’urine en milieu MHR et ceux obtenus à partir d’une subculture en milieu MH. Cette technique rapide entraîne un gain de temps important : le délai d’obtention d’un antibiogramme est alors de 8h, contre 48h par rapport à la méthode standard de réalisation d’un ECBU, ce qui permet une adaptation thérapeutique précoce. Cette technique est cependant dépendante d’un inoculum bactérien minimum ainsi que du caractère monomicrobien de l’urine.