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Differentially expressed circular RNAs in systemic lupus erythematosus and their clinical significance - 20/09/18

Doi : 10.1016/j.biopha.2018.08.161 
Ming-Yue Zhang a, b, c, 1, Jie-Bing Wang b, c, 1, Zhi-Wei Zhu b, c, Lian-Ju Li b, c, Rui-Shan Liu c, Xiao-Ke Yang d, Rui-Xue Leng b, c, Xiao-Mei Li e, Hai-Feng Pan b, c, , Dong-Qing Ye b, c,
a Department of Medical Record Room, Medical Affairs, The Affiliated Fuyang Hospital of Anhui Medical University, 99 Huangshan Road, Fuyang, Anhui 236000, PR China 
b Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Anhui Medical University, 81 Meishan Road, Hefei, Anhui, 230032, PR China 
c Anhui Province Key Laboratory of Major Autoimmune Diseases, 81 Meishan Road, Hefei, Anhui, 230032, PR China 
d Department of Rheumatology and Immunology, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, 218 Jixi Road, Hefei, Anhui 230022, PR China 
e Department of Rheumatology, Anhui Provincial Hospital, 17 Lujiang Road, Hefei, Anhui, China 

Corresponding author at: Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Anhui Medical University, 81 Meishan Road, Hefei, Anhui, 230032, PR China.Department of Epidemiology and BiostatisticsSchool of Public HealthAnhui Medical University81 Meishan RoadHefeiAnhui230032PR China

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Highlights

Provide a expression profile of circRNAs in plasma of SLE patients.
Verify the expression levels of circRNA both in plasma and PBMCs.
Reveal the potential ceRNAs for differentially expressed circRNA.

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Abstract

It has been reported that circRNAs are diff ;erentially expressed in many diseases and can be used as new biomarker to facilitate disease diagnosis. Circular RNAs (circRNAs) microarray were used to identify dysregulated circRNAs in plasma of systemic lupus erythematosus (SLE) patients. Then, we confirmed the microarray data by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) in both plasma and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of SLE. One hundred and twelve circRNAs were identified to dysregulated expressed in plasma of SLE as compared to healthy controls. The results of qRT-PCR showed that the levels of hsa_circRNA_407176 and hsa_circRNA_001308 were decreased in both plasma and PBMCs of SLE when compared with healthy controls. The receiver operating characteristic (ROC) curve area of hsa_circRNA_407176 and hsa_circRNA_001308 in plasma were 0.599 and 0.662, respectively. The area under the ROC curves of hsa_circRNA_407176, hsa_circRNA_406567 and hsa_circRNA_001308 in PBMCs were 0.806, 0.744, and 0.722, respectively. Our study illustrated that hsa_circRNA_407176 and hsa_circRNA_001308 in plasma and PBMCs could be potential biomarkers for SLE.

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Abbreviations : SLE, miRNA, lncRNA, circRNA, CDR1as, qRT-PCR, PBMCs, ceRNA, SLEDAI-2k, FC, FDR, ROC curve, AUC, anti-SSA, CRP, HCC, MSCs, NF-kB

Keywords : Circular RNA, Systemic lupus erythematosus, Microarray, Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction


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Vol 107

P. 1720-1727 - novembre 2018 Retour au numéro
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