O11 La cartographie des SNP du gène WFS1 révèle son rôle dans le diabète de type 2 associé à une surdité neurosensorielle dans la population française - 21/12/10
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Résumé |
But |
WFS1 est un gène impliqué dans le syndrome de Wolfram qui associe un diabète de type 1, une atrophie optique et des manifestations telles qu’une surdité, un diabète insipide et des signes neurologiques. Des mutations ont été également décrites dans des surdités familiales non syndromiques. Récemment, des études pangénomiques ont montré une association entre des SNP de ce gène et le diabète de type 2 (DT2). Notre objectif a été d’explorer le rôle de WFS1 dans le DT2 associé à une surdité neurosensorielle par cartographie dense des SNP.
Patients et Méthodes |
L’étude cas-témoins d’association a été réalisée sur une population de DT2 associé à une surdité neurosensorielle (n = 101) des CHU de Marseille et Nice. Les diabètes de type 1 ou liés à une mutation de l’ADN mitochondrial ont été exclus. La population témoin est représentée par des sujets (n = 140) recrutés de manière randomisée dans la population générale du sud de la France et appariés pour l’âge (
60 ans).
Résultats |
Le criblage des 8 exons du gène nous a permis de déterminer les sites variables et les blocs de déséquilibre de liaison (DL). Une vingtaine de SNP apparaissent communs aux cas et témoins dont 14 (fréquences de l’allèle mineur = 10 %) dans une région de très fort DL comprenant l’exon 8 et la région 3’UTR. Cette région a été ainsi choisie pour l’analyse des haplotypes. Les génotypes GG et CC des SNP rs1801212 et rs1046319 auraient un rôle protecteur et se révèlent en régression logistique comme diminuant le risque de 5 fois (P < 0,036, OR 0, 213 ; 95 % CI [0,05-1,0]). Afin de tester le rôle des différentes combinaisons des SNP, nous avons reconstruit les haplotypes (PHASE) formés par 9 SNP et montré qu’un haplotype composé des allèles A et T de ces 2 SNP est 17 fois plus fréquent chez les patients et s’associe fortement à la maladie avec P < 0,0005 ; OR 14,5 ; 95 % CI 1, 8-114, 5.
Conclusion |
Ces données démontrent pour la première fois l’implication du gène WFS1 dans le le diabète de type 2 associé à une surdité neurosensorielle dans la population française et atteste la supériorité de l’analyse des haplotypes par rapport aux SNP individuels.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.
Vol 36 - N° S1
P. A3 - mars 2010 Retour au numéro
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