Détection directe et rapide du portage de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline par extraction automatisée de l'acide nucléique et PCR en temps réel

Nous avons développé une stratégie de dépistage des Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (SARM) par PCR en temps réel capable de fournir un résultat endéans les trois heures. L'amplification génique reconnaît un fragment de 184 pb correspondant à la région de jonction entre les gènes mecA et orfX ce qui permet une identification spécifique des SARM dans un prélèvement non stérile. Mille quatre cent quatre-vingt-un écouvillons nasaux prélevés chez des patients des services de gériatrie, de dialyse et de soins intensifs ont été comparés à la bactériologie classique. Une courte centrifugation, préalable à l'extraction, avec le dispositif « SETS » permet une récupération de l'échantillon. L'extraction de l'ADN est réalisée par l'automate MagNA Pure LC et la réaction d'amplification par le LightCycler. La concordance entre les deux méthodes est de 97,7 %. Une étude de sensibilité et spécificité sur 1111 échantillons donne respectivement 75 et 98 % pour la PCR en temps réel et 64 et 99 % pour la culture. La stratégie de dépistage rapide et efficace que nous proposons est d'un apport indéniable dans la lutte contre les infections à SARM.