L'obturation du système endodontique est le complément indispensable de la préparation canalaire. Elle doit être tridimensionnelle, étanche et durable afin de maintenir les effets obtenus lors du parage et de la mise en forme. Les matériaux d'obturation les plus couramment utilisés restent à ce jour les ciments de scellement canalaires à base d'oxyde de zinc-eugénol associés à la gutta-percha. Le ciment est indispensable car il assure l'étanchéité et le joint entre la gutta et les parois dentinaires. La gutta-percha reste le matériau d'obturation canalaire incontournable et les techniques condensées continuent à s'imposer comme des procédures de référence. Les solvants sont utilisés avec plus ou moins d'efficacité lors des retraitements endodontiques mais ils s'avèrent tous irritants et toxiques. Ils doivent donc être utilisés avec prudence et parcimonie.