En cancérologie digestive, l'indication principale de la tomographie par émission de positons (TEP)/tomodensitométrie (TDM) au fluorodésoxyglucose (FDG) est la détection et l'évaluation préopératoire des récidives des cancers colorectaux, avec impact majeur et pertinent reconnu dans la prise en charge thérapeutique. La TEP/TDM au FDG est également recommandée pour la stadification préopératoire des cancers de l'œsophage. Sa performance est reconnue, mais les indications en sont moins codifiées, pour la prise en charge des carcinomes épidermoïdes du canal anal, des cancers de la vésicule biliaire, des cholangiocarcinomes de forme non infiltrante, des cancers du pancréas, des tumeurs stromales et pour l'évaluation de l'efficacité de traitements comme la radiochimiothérapie néoadjuvante des cancers du rectum et de l'œsophage, le traitement par radiofréquence des métastases hépatiques des cancers colorectaux, le traitement par imatinib des tumeurs stromales. Les types histologiques pour lesquels la TEP au FDG peut être prise en défaut correspondent aux adénocarcinomes mucineux, à cellules indépendantes, en bague à chaton ou infiltrants, aux tumeurs neuroendocrines bien différenciées et aux carcinomes hépatocellulaires bien différenciés. Pour ces deux derniers types de tumeurs, des traceurs TEP autres que le FDG sont maintenant disponibles et ont une autorisation de mise sur le marché : la fluorocholine pour la détection des carcinomes hépatocellulaires bien différenciés et la fluoroDOPA pour la détection des tumeurs neuroendocrines bien différenciées. La TEP/TDM à la fluoroDOPA est extrêmement performante pour la détection des tumeurs neuroendocrines bien différenciées ayant le grêle pour origine mais moins performante pour la détection des tumeurs neuroendocrines bien différenciées d'origine duodénopancréatique (à l'exception de son excellente performance pour l'exploration des hyperinsulinismes de l'enfant, permettant le diagnostic différentiel entre forme focale et forme diffuse). La TEP/TDM utilisant un analogue de la somatostatine est une méthode très performante de détection des tumeurs neuroendocrines digestives (en particulier duodénopancréatiques), actuellement en cours d'évaluation en France.