L'antibiothérapie précoce en cas de suspicion de méningococcie rend difficile l'isolement de Neisseria meningitidis. Des méthodes moléculaires de diagnostic sans culture sont récemment développées en utilisant la technique de l'amplification génique. Les prélèvements correspondent le plus souvent au sang et au liquide céphalorachidien (LCR), mais d'autres types de prélèvements peuvent être testés comme le liquide articulaire et le liquide péricardique. Plusieurs stratégies sont actuellement utilisées. L'ADN de N. meningitidis est d'abord détecté, ensuite le sérogroupe est prédit (génogroupage). N. meningitidis est une bactérie variable à cause des fréquents échanges horizontaux d'ADN entre les souches. Les approches moléculaires de typage permettent une traçabilité fiable des souches bactériennes et une analyse épidémiologique puissante.

Culture-confirmed diagnosis of meningococcal infections is hindered by the failure to isolate Neisseria meningitidis following an early antibiotic treatment, which is highly recommended whenever meningococcal infection is suspected. Molecular methods for nonculture diagnosis of meningococcal infections have been recently developed and they usually use PCR-based detection of meningococcal DNA. Samples correspond most frequently to blood and cerebrospinal fluid (CSF), however, other samples can also be tested such as articular fluid and pericardiac fluid is observed. Several strategies are currently used but they usually a two-step process, the detection of meningococcal DNA and the prediction of serogroup (genogrouping). N. meningitidis is highly variable due to frequent horizontal DNA exchange between strains. Molecular approaches of typing allow a reliable tracking of meningococcal strains and a powerful epidemiological analysis.