Le Doppler transcrânien et l'échodoppler transcrânien permettent un examen non invasif des artères cérébrales. Ils sont particulièrement utiles à l'étude des aspects dynamiques de la circulation cérébrale. Les principales applications cliniques sont l'évaluation du risque d'accident vasculaire cérébral en aval d'une sténose de la carotide, le diagnostic des sténoses et des occlusions des artères cérébrales, notamment à la phase aiguë de l'accident vasculaire cérébral, la recherche du spasme artériel cérébral dans les suites d'une hémorragie méningée, l'évaluation du risque d'accident vasculaire cérébral chez les enfants drépanocytaires, la recherche d'un shunt droit-gauche.