La endoscopia con toma de biopsias es la exploración de primera elección cuando existen síntomas sugestivos de una patología esofágica. Permite diagnosticar las patologías más frecuentes, que son los tumores (benignos o malignos), el reflujo gastroesofágico (RGE) y sus complicaciones (esofagitis, esófago de Barrett), así como la esofagitis eosinofílica. Sus principales indicaciones son la disfagia, los síntomas de RGE con signos de alarma o en caso de resistencia al tratamiento médico, las hemorragias digestivas altas y la búsqueda de signos de hipertensión portal. La pH-metría y la pH-impedanciometría esofágicas son exploraciones ambulatorias que permiten diagnosticar un RGE cuya presentación clínica es atípica o cuando fracasa el tratamiento médico, al proporcionar una evaluación cuantitativa del reflujo y establecer una relación temporal entre los síntomas descritos y los episodios de reflujo registrados. La utilización de la pH-impedanciometría con tratamiento se prefiere en los pacientes con un reflujo patológico documentado previamente. La manometría esofágica permite el diagnóstico de los trastornos motores del esófago. En la actualidad, la manometría denominada de «alta resolución» es el examen de referencia, pues permite identificar los principales trastornos motores esofágicos primarios, que son la acalasia, la enfermedad de los espasmos del esófago, el esófago en «martillo neumático» y el peristaltismo ausente. El significado de las otras anomalías de la motricidad esofágica es incierto.