Étude d’une grande cohorte de patients atteints d’albinisme oculocutané - 27/11/15
Résumé |
Introduction |
L’albinisme est une pathologie hétérogène d’un point de vue clinique et génétique caractérisée par un nystagmus, une hypoplasie de la fovéa et une baisse de l’acuité visuelle, associée à une hypopigmentation de la peau, des cheveux et des yeux. Dix-huit gènes sont impliqués dans les différentes formes d’albinisme : oculocutané (AOC), oculaire (AO, FHONDA) et syndromiques (Hermansky-Pudlak [HPS], Chediak-Higashi [CHS]).
Patients et méthodes |
Le diagnostic moléculaire était réalisé par séquençage nouvelle génération avec la technologie Ion Torrent par méthode AmpliSeq (Life Technologies) couvrant les exons des 18 gènes. Les anomalies de dosage génique étaient identifiées par CGH array haute résolution.
Observations |
Cohorte de 640 patients (cas index).
Résultats |
Une cohorte de 640 patients a été analysée et un diagnostic a pu être établi pour 479 d’entre eux (74,8 %) : 31,8 % AOC1 ; 22,5 % AOC2 ; 2 % AOC3 ; 8,6 % AOC4 ; 2 % AOC6 ; 5,5 % AO ; 1,5 % HPS1 ;0,15 % HPS4 ;0,45 % HPS5 ; 0,3 % HPS6.
Dix pour cent des patients étaient porteurs d’une mutation hétérozygote et 15,2 % ne présentaient aucune mutation dans ces gènes.
Discussion |
Pourquoi 25,2 % des patients restent-ils donc sans diagnostic moléculaire ? Alors que l’albinisme est considéré comme maladie monogénique, la découverte d’un digénisme (TYR/OCA2) dans une famille suggère qu’un oligogénisme pourrait être responsable d’autres cas d’albinisme. Certaines mutations ne sont pas détectées car probablement localisées dans les introns ou dans des sites de régulation éloignés. De plus, elles peuvent se situer dans des régions mal couvertes par notre technique de séquençage comme le démontre notre exemple d’une mutation homozygote dans HPS8 détectée en modifiant les critères des filtres bio-informatiques et en faisant une lecture approfondie des séquences brutes (fichiers BAM).
Conclusion |
Il est probable que d’autres gènes impliqués dans l’albinisme restent à découvrir.
Les espoirs et limites du séquençage d’exomes pour la recherche de nouveaux gènes impliqués dans l’albinisme seront discutés.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Albinisme oculocutané, Génétique, Séquençage nouvelle génération
Plan
Vol 142 - N° 12S
P. S589 - décembre 2015 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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