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Stabilization of an ?-helix by short adjacent accessory foldamers - 15/03/16

Doi : 10.1016/j.crci.2015.07.003 
Laura Mauran a, b, c, Brice Kauffmann d, e, f, Benoit Odaert b, g, Gilles Guichard a, b,
a Univ. Bordeaux, CBMN, UMR 5248, Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB), 2 rue Robert Escarpit, 33607 Pessac, France 
b CNRS, CBMN, UMR 5248, 33600, Pessac, France 
c UREkA, Sarl, 2 rue Robert Escarpit, 33607 Pessac, France 
d Univ. Bordeaux, IECB, UMS 3033/US 001, 2 rue Robert Escarpit, 33607 Pessac, France 
e CNRS, IECB, UMS 3033, 33600 Pessac, France 
f INSERM, IECB, US 001, 33600 Pessac, France 
g Univ. Bordeaux, CBMN, UMR 5248, All. Geoffroy Saint-Hilaire, 33600 Pessac, France 

Corresponding author. Univ. Bordeaux, CBMN, UMR 5248, Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB), 2 rue Robert Escarpit, 33607 Pessac, France.

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Abstract

Template-based stabilization of α-peptide helices with short accessory non-peptide helical foldamers fused either at the N- or C-terminus or at both ends of the peptide segment has been investigated by NMR spectroscopy in polar solvents and by X-ray diffraction. In this work, we focused on aliphatic N,N′-linked oligoureas that form predictable and well-defined helical structures akin to α-helices. Our results indicate that urea oligomers have the ability to enforce a peptide segment to adopt a well-defined α-helical structure and may suggest a general approach to stabilize short helical peptide epitopes for the development of modulators of protein–protein interactions.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Resume

Nous avons étudié la capacité de foldamères accessoires non peptidiques fusionnés à l’une ou l’autre, ou aux deux extrémités d’une séquence peptidique, à servir de matrice de nucléation d’une structure hélicoïdale dans la partie peptidique. Dans ce but, nous avons choisi de travailler avec des oligomères d’urées N, N’-liées connus pour former des structures hélicoïdales bien définies et présentant une certaine ressemblance avec l’hélice α. Les résultats de cette étude par RMN et par diffraction des rayons X indiquent que de courts segments oligourées ont la capacité d’induire une conformation en hélice α dans la section peptidique adjacente, ce qui permet de suggérer une méthode pour stabiliser des épitopes peptidiques adoptant une conformation en hélice au contact de leur cible en vue de développer de nouveaux modulateurs des interactions protéine-protéine.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Helices, Peptides, Foldamers, Structure, Oligoureas, X-ray crystallography

Mots Clés : Hélices, Peptides, Foldamères, Structure, Oligoureas, Cristallographie


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Vol 19 - N° 1-2

P. 123-131 - janvier 2016 Retour au numéro
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  • Self-assembly of benzene-tris(bis(p-benzyloxy)triphenylamine)carboxamide
  • Émilie Moulin, Eric Busseron, Yuya Domoto, Thomas Ellis, Artem Osypenko, Mounir Maaloum, Nicolas Giuseppone
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  • Solid phase synthesis of oligoethylene glycol-functionalized quinolinecarboxamide foldamers with enhanced solubility properties
  • Christos Tsiamantas, Simon J. Dawson, Ivan Huc

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