Human microbiota plays a major role as natural reservoir for bacterial resistance. Fluoroquinolones (FQ) are among the most prescribed antibiotics and a major increase in FQ-resistance is occurring worldwide. FQ diffuse particularly well in microbiota, which explains their profound effect on the clinically relevant bacteria that compose them. Yet, because of different local pharmacokinetics, distinct selective pressures occur in the different microbiota. However, the overall qualitative and quantitative impact of FQ on human microbiota is major in particular in terms of emergence of bacterial resistance.

Le microbiote humain joue un rôle majeur comme réservoir naturel de la résistance bactérienne. Les fluoquinolones (FQ) sont parmi les antibiotiques les plus prescrits avec une augmentation mondiale du taux de résistance aux FQ. Les FQ ont une excellente diffusion dans les différents microbiotes humains ce qui explique leur impact majeur sur les espèces bactériennes qui y sont représentées. En raison des différences pharmacocinétiques dans les différents microbiotes, différentes pressions de sélection sont exercées dans chaque microbiote. Cependant, l’impact global qualitatif et quantitatif des FQ sur les microbiotes humains est majeur, particulièrement en termes d’émergence de la résistance bactérienne.