Le microbiote pulmonaire est aujourd’hui considéré comme une communauté poly-microbienne composée de bactéries (bactériote), de virus et phages, mais aussi de micromycètes (mycobiote) [1Huang Y.J., Lynch S.V. The emerging relationship between the airway microbiota and chronic respiratory disease: clinical implications Expert Rev Respir Med 2011 ;  5 : 809-821 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références, 2Delhaes L., et al. The airway microbiota in cystic fibrosis: a complex fungal and bacterial community--implications for therapeutic management PLoS One 2012 ;  7 (4) : e36313

Cliquez ici pour aller à la section Références, 3Rogers G.B., et al. Respiratory microbiota: addressing clinical questions, informing clinical practice Thorax 2015 ;  70 : 74-81 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références, 4Nguyen L.D.N., Viscogliosi E., Delhaes L. The lung mycobiome: an emerging field of the human respiratory microbiome Front Microbiol 2015 ;  6 : 1-9 [inter-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références]. Dans le cas de la mucoviscidose–qui nous intéresse dans ce travail–la composition de ce microbiote est corrélée à l’évolution clinique des patients [1Huang Y.J., Lynch S.V. The emerging relationship between the airway microbiota and chronic respiratory disease: clinical implications Expert Rev Respir Med 2011 ;  5 : 809-821 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références, 2Delhaes L., et al. The airway microbiota in cystic fibrosis: a complex fungal and bacterial community--implications for therapeutic management PLoS One 2012 ;  7 (4) : e36313

Cliquez ici pour aller à la section Références, 3Rogers G.B., et al. Respiratory microbiota: addressing clinical questions, informing clinical practice Thorax 2015 ;  70 : 74-81 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références, 4Nguyen L.D.N., Viscogliosi E., Delhaes L. The lung mycobiome: an emerging field of the human respiratory microbiome Front Microbiol 2015 ;  6 : 1-9 [inter-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références].

Nous rapportons ici la caractérisation par séquençage haut-débit, des microbiotes bactériens et fongiques respiratoire et de l’environnement intérieur immédiat d’une patiente mucoviscidosique. Cette patiente était porteuse d’une atteinte pulmonaire assez sévère avec aspergillose bronchopulmonaire allergique (ABPA), compliquée au moment de l’analyse NGS d’une exacerbation pulmonaire aiguë. Le recueil de la contamination environnementale intérieure a été réalisé grâce au dépôt d’un piège à poussière durant 10 semaines dans la chambre de la patiente, selon le protocole établi en étroite collaboration avec l’équipe du CHU de Besançon [5Rocchi S., et al. Evaluation of mold exposure in cystic fibrosis patients’ dwellings and allergic bronchopulmonary risk J Cyst Fibros 2015 ;  14 (2) : 242-247 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références]. Les résultats et l’intérêt clinique d’une telle approche sont discutés, en tenant compte des études récentes [6Sapet A., et al. Is the home environment an important factor in the occurrence of fungal events in cystic fibrosis? J Cyst Fibros 2015 ;  14 (5) : E16-E18

Cliquez ici pour aller à la section Références, 5Rocchi S., et al. Evaluation of mold exposure in cystic fibrosis patients’ dwellings and allergic bronchopulmonary risk J Cyst Fibros 2015 ;  14 (2) : 242-247 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références] montrant l’importance de l’exposition fongique comme facteur favorisant la survenue d’une ABPA dans la mucoviscidose.