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Indoor microbial communities: Influence on asthma severity in atopic and nonatopic children - 01/07/16

Doi : 10.1016/j.jaci.2015.11.027 
Karen C. Dannemiller, PhD a, Janneane F. Gent, PhD b, Brian P. Leaderer, PhD b, Jordan Peccia, PhD a,
a Department of Chemical and Environmental Engineering, Yale University, New Haven, Conn 
b Yale Center for Perinatal, Pediatric and Environmental Epidemiology, Yale School of Public Health, New Haven, Conn 

Corresponding author: Jordan Peccia, PhD, Department of Chemical and Environmental Engineering, Yale University, Mason Laboratory, 9 Hillhouse Ave, New Haven, CT 06520-8286.Department of Chemical and Environmental EngineeringYale UniversityMason Laboratory9 Hillhouse AveNew HavenCT06520-8286

Abstract

Background

Allergic and nonallergic asthma severity in children can be affected by microbial exposures.

Objective

We sought to examine associations between exposures to household microbes and childhood asthma severity stratified by atopic status.

Methods

Participants (n = 196) were selected from a cohort of asthmatic children in Connecticut and Massachusetts. Children were grouped according to asthma severity (mild with no or minimal symptoms and medication or moderate to severe persistent) and atopic status (determined by serum IgE levels). Microbial community structure and concentrations in house dust were determined by using next-generation DNA sequencing and quantitative PCR. Logistic regression was used to explore associations between asthma severity and exposure metrics, including richness, taxa identification and quantification, community composition, and concentration of total fungi and bacteria.

Results

Among all children, increased asthma severity was significantly associated with an increased concentration of summed allergenic fungal species, high total fungal concentrations, and high bacterial richness by using logistic regression in addition to microbial community composition by using the distance comparison t test. Asthma severity in atopic children was associated with fungal community composition (P = .001). By using logistic regression, asthma severity in nonatopic children was associated with total fungal concentration (odds ratio, 2.40; 95% CI, 1.06-5.44). The fungal genus Volutella was associated with increased asthma severity in atopic children (P = .0001, q = 0.04). The yeast genera Kondoa might be protective; Cryptococcus species might also affect asthma severity.

Conclusion

Asthma severity among this cohort of children was associated with microbial exposure, and associations differed based on atopic status.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Key words : Allergy, asthma severity, atopy, bacteria, children, DNA sequencing, fungi, indoor environment, microbial communities, nonallergic asthma

Abbreviations used : ITS, OTU, qPCR


Plan


 Supported by the Alfred P. Sloan Foundation (Microbiology of the Build Environment) and a grant from the National Institutes of Health (ES05410).
 Disclosure of potential conflict of interest: B. P. Leaderer receives research support from National Institute of Environmental Health Sciences ES05410. J. Peccia receives research support from the Alfred P. Sloan Foundation. The rest of the authors declare that they have no relevant conflicts of interest.


© 2016  American Academy of Allergy, Asthma & Immunology. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
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Vol 138 - N° 1

P. 76 - juillet 2016 Retour au numéro
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