Détection de l’ADN tumoral circulant (ctDNA) dans les corticosurrénalomes - 07/09/16
Résumé |
Introduction |
Les cancers relarguent dans la circulation de l’ADN tumoral circulant. Le ctDNA peut être détecté en recherchant dans le plasma les mutations somatiques préalablement identifiées dans la tumeur. Les mutations somatiques du corticosurrénalome ont été récemment identifiées par séquençage d’exome.
Objectif |
Démontrer la présence de ctDNA chez des patients porteurs de corticosurrénalome.
Méthode |
Pour chaque patient, la/les mutation(s) somatiques spécifiques sont recherchées par NGS ciblant 20 gènes (Ampliseq, Life Technologies) à partir de tumeur congelée et d’ADN leucocytaire. L’ADN plasmatique est extrait soit avant chirurgie, soit dans le contexte de métastases, puis quantifié par Qubit (Life Technologies). Nous nous focalisons d’abord sur la mutation hotspot S45 de CTNNB1 (gène de beta-caténine). La mutation est recherchée par 2 méthodes : soit NGS ciblé sur un amplicon, à très forte profondeur (AmpliSeq), soit PCR digitale en gouttelettes avec un dessin spécifique (QX100, BioRad). D’autres mutations sont analysées.
Résultats |
La fréquence des mutations somatiques retrouvées en NGS ciblé est conforme aux données d’exomes antérieures. Les ADN plasmatiques sont quantifiés entre 1 et 40ng/μL. La mutation S45 de CTNNB1 (gène de la b-caténine) identifiée dans la tumeur d’un patient, est retrouvée dans l’ADN plasmatique par NGS ciblé (17 131 reads sur 111 572 [13 %]). En PCR digitale, la mutation est retrouvée dans 251 gouttelettes sur 1649 (15,2 %). Les résultats de 4 autres patients seront également présentés.
Conclusion |
Le ctDNA est détectable dans les corticosurrénalomes. Si la sensibilité de détection et la précision de quantification le permettent, il pourrait s’agir d’un biomarqueur important de suivi personnalisé.
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Vol 77 - N° 4
P. 278 - septembre 2016 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.