Analyse des mutations des gènes RAS par technique Cobas® au sein d’une structure de pathologie libérale : étude médico-économique et moléculaire comparative avec une plateforme labellisée INCa - 20/07/17
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Résumé |
En France, la détermination du statut mutationnel des gènes RAS à visée prédictive de réponse aux traitements ciblés anti-EGFR est réalisée par les plateformes de génétique moléculaire des cancers créées par l’Institut national du cancer. Cette étude vise à démontrer la faisabilité de ces analyses par une structure libérale de pathologie (MEDIPATH) dans des conditions d’accréditation. Nous avons étudié rétrospectivement le statut mutationnel des gènes KRAS et NRAS dans 163 cas de cancer colorectal métastatique par technique Cobas®. Nous avons comparé nos résultats à ceux obtenus prospectivement par pyroséquençage et discrimination allélique par le laboratoire de génétique des tumeurs solides du CHU de Nice, (plateforme PACA-EST). Les résultats des deux séries étaient concordants : corrélation positive de 98,7 % ; corrélation négative de 93,1 % ; corrélation globale de 95,7 % (Kappa=0,92). Nous avons analysé le coût de revient d’un test. Cette étude démontre la faisabilité des analyses moléculaires dans une structure libérale. Cette pratique nécessitant un niveau élevé de garantie, son accréditation selon la norme NF-EN-ISO15189 est indispensable. La réalisation d’analyses moléculaires dans ce contexte permet d’éviter les étapes d’acheminements du prélèvement et du résultat, entre le laboratoire de pathologie et la plateforme, ce qui permet de réduire le délai global de rendu du résultat. En conclusion, le transfert de certaines analyses des plateformes vers des structures libérales permettrait aux plateformes d’être déchargées d’une partie d’analyses courantes, validées et de pouvoir consacrer leurs efforts au développement de nouvelles analyses continuellement requises pour l’accès à la médecine personnalisée.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Summary |
In France, determination of the mutation status of RAS genes for predictive response to anti-EGFR targeted treatments is carried out by public platforms of molecular biology of cancer created by the French National Cancer Institute. This study aims to demonstrate the feasibility of these analyses by a private pathology laboratory (MEDIPATH) as per the requirements of accreditation. We retrospectively studied the mutation status of KRAS and NRAS genes in 163 cases of colorectal metastatic cancer using the Cobas® technique. We compared our results to those prospectively obtained through pyrosequencing and allelic discrimination by the genetic laboratory of solid tumors at the Nice University Hospital (PACA-EST regional platform). The results of both series were identical: 98.7% positive correlation; negative correlation of 93.1%; overall correlation of 95.7% (Kappa=0.92). This study demonstrates the feasibility of molecular analysis in a private pathology laboratory. As this practice requires a high level of guarantee, its accreditation, according to the NF-EN-ISO15189 quality compliance French standard, is essential. Conducting molecular analysis in this context avoids the steps of routing the sample and the result between the pathology laboratory and the platform, which reduces the overall time of rendering the result. In conclusion, the transfer of some analysis from these platforms to private pathology laboratories would allow the platforms to be discharged from a part of routine testing and therefore concentrate their efforts to the development of new analyses constantly required to access personalized medicine.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Pathologie moléculaire, RAS, Accréditation
Keywords : Molecular pathology, RAS, Accreditation
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Vol 104 - N° 7-8
P. 662-674 - juillet 2017 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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