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Histologie spectrale par imagerie moyen-infrarouge et sélection de variables - 28/11/17

Doi : 10.1016/j.morpho.2017.07.025 
Abbas Ramal a, , Que Nguyen b, Dominique Guenot c, Pierre Jeannesson a, Cyril Gobinet a
a Laboratoire biophotonique, UMR CNRS 7369, URCA, Reims, France 
b Diamond Light Source, Harwell Science and Innovation Campus, Chilton, Royaume-Uni 
c LEA 3430 progression tumorale et microenvironnement, approches translationnelles et épidémiologie, fédération de médecine translationnelle de Strasbourg (FMTS), université de Strasbourg (Unistra), Strasbourg, France 

Auteur correspondant.

Résumé

Objectif

L’imagerie spectrale moyen-infrarouge est une technique d’analyse de la composition biomoléculaire d’un échantillon biologique basée sur l’interaction lumière–matière. Une image spectrale est un cube de données composé de plusieurs centaines de variables (nombres d’onde). Un défi dans l’application de cette technologie en histopathologie spectrale est l’identification de marqueurs spectraux spécifiques des structures histopathologiques des tissus biologiques étudiés.

Matériel et méthodes

Nous avons développé un algorithme réalisant simultanément une classification non-supervisée et une sélection de variable. Cette nouvelle méthode est basée sur un algorithme génétique couplé à un indice de validité.

Résultats

Appliquée à des images moyen-infrarouge acquises sur des coupes tissulaires de côlon humain normal provenant de cinq patients, cette méthodologie est capable de diviser les données spectrales en classes tissulaires et de trouver, de manière non-supervisée, les variables spectrales (nombres d’onde) permettant de discriminer au mieux ces classes tissulaires.

Conclusion

Ses variables (nombres d’onde) intéressantes peuvent être corrélées à des groupes chimiques fonctionnels spécifiques des échantillons étudiés, et donc mener à la définition de marqueurs spectraux, notamment tumoraux.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Spectroscopie infrarouge, Histologie spectrale, Méthodologie, Traitement de données


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Vol 101 - N° 335

P. 249 - décembre 2017 Retour au numéro
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