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Méthodes d’étude du traductome régulé par les récepteurs couplés aux protéines G - 07/03/18

Investigation methods to explore G protein-coupled receptor-regulated translatome

Doi : 10.1016/j.crvi.2017.12.002 
Aurélie Tréfier a, c, d, e, Florian Guillou b, c, d, e, Pascale Crépieux a, c, d, e,
a Groupe Biologie et bioinformatique des systèmes de signalisation, Inra, UMR 85, unité Physiologie de la reproduction et des comportements, 37380 Nouzilly, France 
b Plasticité génomique et expression phénotypique, Inra, UMR 85, unité Physiologie de la reproduction et des comportements, 37380 Nouzilly, France 
c CNRS, UMR 7247, 37380 Nouzilly, France 
d Université François-Rabelais, 37041 Tours, France 
e IFCE, 37380 Nouzilly, France 

?Auteur correspondant.Unité Physiologie de la reproduction et des comportements, Centre INRA Val de Loire, Université François-Rabelais, 37380 Nouzilly, France

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Résumé

Depuis l’avènement des méthodes de séquençage à haut débit, l’identification du traductome, qui comprend l’ensemble des ARNm associés aux ribosomes, ouvre de nouvelles perspectives pour définir le répertoire des protéines réellement exprimées dans une cellule, contrairement au séquençage du transcriptome correspondant. De plus, l’impact que les signaux extracellulaires tels que des modulations hormonales peuvent avoir sur le traductome reste méconnu. En particulier, la régulation du traductome par les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) est un domaine encore peu exploré, alors que de nombreux récepteurs de cette famille jouent un rôle trophique très important dans leur cellule cible. L’objectif de cette revue est de présenter les méthodes les plus utilisées pour étudier le traductome, en les appliquant aux RCPG.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

With the advent of next-generation sequencing technologies, identifying the translatome, which includes genome-wide ribosome-associated mRNAs, provides new opportunities to define faithfully the protein repertoire of a cell, as opposed to transcriptomic approaches. In addition, the role that extracellular signals such as hormonal modulations could play on the translatome remains to be deciphered. In particular, the regulation of the translatome by G protein-coupled receptors (GPCR) is still poorly described, albeit the trophic role that many receptors of this family play in their target cells. Here, we provide an overview of the current methods that are used to study the translatome, applied to the GPCR receptor family.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Traductome, Récepteurs couplés aux protéine G, Profilage ribosomique, Profilage polysomique, Purification par affinité de ribosomes en cours de traduction

Keywords : Translatome, G protein-coupled receptor, Ribosome profiling, Polysome profiling, Translating ribosome affinity purification


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Vol 341 - N° 2

P. 65-74 - février 2018 Retour au numéro
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  • A euryhaline fish, lost in the desert: The unexpected metapopulation structure of Coptodon guineensis (Günther, 1862) in the Sebkha of Imlili
  • Jean-François Agnèse, Halima Louizi, André Gilles, Ouafae Berrada Rkhami, Abdelaziz Benhoussa, Abdeljebbar Qninba, Antoine Pariselle

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