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Sequence-based identification, genotyping and virulence factors of Trichosporon asahii strains isolated from urine samples of hospitalized patients (2011–2016) - 06/07/18

Doi : 10.1016/j.mycmed.2018.06.006 
G. Hazirolan a, , N. Koçak b, A. Karagöz c
a Hacettepe University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji ABD, Sıhhiye, 06100 Ankara, Turkey 
b Selçuk Üniversity Medicine Faculty, Department of Medical Genetics, Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik ABD Selçuklu/Konya, Ankara, Turkey 
c Public Health Agency of Turkey, National Molecular Microbiology Reference Centers Laboratory, Türkiye Halk Sağlığı Kurumu, Moleküler Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarları, Adnan Saygun Cad. No: 55 Sıhhiye, Ankara, Turkey 

Corresponding author.
Sous presse. Épreuves corrigées par l'auteur. Disponible en ligne depuis le vendredi 06 juillet 2018
Cet article a été publié dans un numéro de la revue, cliquez ici pour y accéder

Summary

Introduction

Trichosporon asahii is the most common species that causes trichosporonosis.

Materials and methods

In the present study, a collection of 68T. asahii strains recovered from hospitalized patients urine samples between 2011 and 2016 was examined. T. asahii strains were identified by sequencing the intergenic spacer 1 region (IGS1) and genotyped. In addition, proteinase, phospholipase, esterase, haemolytic activity, and biofilm formation of a total of T. asahii strains were investigated.

Results

The predominant genotype was 1 (79.3%) and followed by 5 (8%), 3 (6.9%), 6 (3.4%), 4 (1.1%), 9 (1.1%). In none of the 68 strains, proteinase and phospholipase activities could be detected, while all were found to be esterase positive. Biofilm production and hemolytic activity were detected in 23.5 and 97% respectively.

Discussion

Our results indicated that six genotypes were (1, 5, 3, 6, 4, 9) present among T. asahii strains and no property was found to associate with a genotype, in terms of virulence factors.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Trichosporon asahii, Intergenic spacer 1 region, Sequence-based identification, Genotyping, Virulence factors


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