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Développement et mise en place d’un compte rendu standardisé d’anatomopathologie pour les tumeurs pulmonaires à l’aide d’une application de saisie et d’export des données : l’application PELICAN - 07/02/19

Development and deployment of a standardized pathology report in lung cancer, basing on a data management software: The PELICAN software

Doi : 10.1016/j.annpat.2018.12.001 
Clémence Yguel a, Dominique Clauzon b, Stéphanie Lacomme c, Joelle Siat d, Sandra Lomazzi c, Emilie Lardenois a, Luc Taillandier e, Jean-Michel Vignaud a, c, f, Guillaume Gauchotte a, , c, f
a Service d’anatomie et cytologie pathologiques, hôpital Central, CHRU de Nancy, 29, avenue du Maréchal-De-Lattre de Tassigny, 54000 Nancy, France 
b Ingénieur consultant en solutions et développements informatiques, 54000 Nancy, France 
c Centre de ressources biologiques BB-0033-00035, CHRU de Nancy, 54000 Nancy, France 
d Service de chirurgie thoracique, CHRU de Nancy, 54500 Vandoeuvre-Les-Nancy, France 
e Service de neurologie, hôpital Central, CHRU de Nancy, 54000 Nancy, France 
f INSERM U1256, équipe 3 MIGB, NGERE, université de Lorraine, 54500 Vandoeuvre-Les-Nancy, France 

Auteur correspondant.
Sous presse. Épreuves corrigées par l'auteur. Disponible en ligne depuis le jeudi 07 février 2019
Cet article a été publié dans un numéro de la revue, cliquez ici pour y accéder

Résumé

Introduction

L’application PELICAN (« partager éfficacement en laboratoire les informations des comptes rendus anatomopathologiques ») est un outil permettant de générer des comptes rendus standardisés et de créer des bases de données utilisables à visée scientifique. Cette application est utilisée dans notre laboratoire depuis 2014 en neuropathologie tumorale. L’objectif de ce travail était de l’étendre à un autre type de tumeur, le cancer du poumon.

Matériel et méthodes

Le contenu des comptes rendus était au préalable défini à l’aide de divers référentiels (Société française de pathologie, institut national du cancer, classification OMS 2015, …). Une double codification SNOMED et ADICAP était utilisée. L’application PELICAN est un fichier Microsoft Excel comportant un logiciel spécifiquement développé pour les laboratoires, écrit en Visual Basic pour Applications, et respectant la norme CDA-R2.

Résultats

Après établissement du cahier des charges, une bêta-version a été installée en février 2018. Diverses mises à jour ont ensuite été réalisées, la version 3.19 ayant été installée en juillet 2018. La quasi-totalité des pièces d’exérèse fait ainsi aujourd’hui l’objet d’un compte-rendu généré par l’application PELICAN. Un total de 56 comptes-rendus a été validé au moment de la rédaction de cet article. Par rapport aux comptes rendus classiques, le temps médical de génération du compte rendu est globalement le même, voire diminué, le temps de secrétariat étant quant à lui fortement diminué.

Conclusion

L’application PELICAN est un outil simple, d’utilisation facile, permettant de générer des comptes rendus standardisés en pathologie pulmonaire, alimentant une base de données facilement exploitable sur le plan statistique.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Introduction

PELICAN (« Partager Éfficacement en Laboratoire les Informations des Comptes rendus ANatomopathologiques ») is a software which generates standardized reports and, in parallel, allows to automatically create a database that can be used for research purpose. This application has been used in our laboratory since 2014 for central nervous system tumors. The aim of this work was to extend it to another type of tumor, lung cancer.

Materials and methods

The content of the pathology reports was previously defined using various standards (Société Française de Pathologie, Institut National du Cancer, WHO Classification 2015, …). A double codification was used with SNOMED and ADICAP codes. The PELICAN application is a Microsoft Excel file containing a software specifically developed for pathology laboratories, written in Visual Basic for Applications and respecting the CDA-R2 standard.

Results

After definition of the software specifications, a beta-version was installed in February 2018. After various updates, the 3.19 version was installed in July 2018. Almost all lung cancer surgical pathology reports are now generated with the PELICAN software; a total of 56 reports were validated at the time of writing this manuscript. The medical time for the generation of the report was globally the same or decreased for some pathologists. The secretarial time was greatly reduced.

Conclusion

The PELICAN software is an easy to use tool that allows to generate standardized reports in pulmonary pathology and to feed a database that can be easily used for statistical purposes.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : PELICAN, Compte-rendu standardisé, Base de données, Anatomie et cytologie pathologiques, Cancer du poumon

Keywords : PELICAN, Standardized report, Database, Pathology, Lung cancer


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