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Biobanques tumorales et gestion des données complexes : enjeux actuels et futurs - 08/04/19

Tumor banks and complex data management: Current and future challenges

Doi : 10.1016/j.annpat.2019.01.017 
Paul Hofman a, , b, c , Georges Dagher d, Pierre Laurent-Puig e, Charles-Hugo Marquette c, f, Fabrice Barlesi g, Frédéric Bibeau h, Bruno Clément i
a Laboratoire de pathologie clinique et expérimentale, hôpital Pasteur, université Côte d’Azur, CHU de Nice, BP 69, 30, avenue de la Voie-Romaine, 06001 Nice cedex 01, France 
b Biobanque hospitalière (BB-0033-00025), hôpital Pasteur, université Côte d’Azur, CHU de Nice, BP 69, 30, avenue de la Voie-Romaine, 06001 Nice cedex 01, France 
c FHU OncoAge, hôpital Pasteur, université Côte d’Azur, CHU de Nice, BP 69, 30, avenue de la Voie-Romaine, 06001 Nice cedex 01, France 
d Biobanques, Inserm US013, hôpital de la Salpêtrière, 47, boulevard de l’Hôpital, 75651 Paris, France 
e UMR-1138, Inserm, département de biologie, hôpital européen Georges-Pompidou, université Paris Descartes, Assistance publique–Hôpitaux de Paris, 20, rue Leblanc, 75015 Paris, France 
f Service de pneumologie, hôpital Pasteur, université Côte d’Azur, CHU de Nice, BP 69, 30, avenue de la Voie-Romaine, 06001 Nice cedex 01, France 
g Service d’oncologie multidisciplinaire et innovations thérapeutiques, Aix-Marseille université, Assistance publique–Hôpitaux de Marseille, 13920 Marseille cedex 15, France 
h Laboratoire de pathologie, CHU de Caen, avenue de la Côte-de-Nacre, 14000 Caen, France 
i Inserm, Inra, nutrition métabolismes et cancer, CRB-Santé, université de Rennes, rue Henri-Le-Guilloux, 35033 Rennes, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

Les biobanques tumorales sont sollicitées dans le cadre du développement de la recherche translationnelle et clinique en cancérologie. Elles participent à l’évaluation puis à la validation des biomarqueurs à visée diagnostique, pronostique ou prédictive. L’évolution progressive de ces structures a permis de professionnaliser leur fonctionnement et de les identifier comme des rouages incontournables en oncologie par les acteurs du monde académique et industriel. Les progrès technologiques et thérapeutiques modifient l’impact et le fonctionnement de ces biobanques, ces dernières devant relever plusieurs défis afin notamment d’être pérennisées. Parmi les enjeux, l’intégration des données (cliniques et biologiques) de plus en plus complexes et massives associées aux échantillons biologiques, conduit à avoir une réflexion urgente pour une organisation optimisée des biobanques en France. Le but est d’être attractif aux yeux des partenaires face à la compétition internationale. Cette revue aborde rapidement les principales évolutions actuelles des biobanques, puis les défis actuels et futurs, et enfin la place que le pathologiste peut jouer dans ces nouveaux challenges de l’oncologie.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Tumor banks are asked to clinical and translationnal research project development in oncology. They strongly participate to the assessment, then to the validation of diagnostic, prognostic and predictive biomarkers. The progressive change of these structures leads to induce a professionalization of their functioning and to identify them as key actors in oncology by the stakeholders of the public and private worlds. The progresses made in biotechnologies and therapeutics are rapidly modifying the impact and the proper functioning of the biobanks. These latter are now facing different challenges, in particular for their sustainability. Among the major issues, the integration of the clinical and biological data becoming increasingly complex leads to urgently consider an optimization of the role of different biobanks in France. Their goal is to be an attractive counterpart face to the international competition. The purpose of this review is to briefly describe the current evolution of the biobanks, then their present and future challenges, and finally the role made by the pathologists in these new issues in oncology field.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Biobanque, Données massives, Défis, Oncologie

Keywords : Biobanks, Big data, Challenges, Oncology


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Vol 39 - N° 2

P. 137-143 - avril 2019 Retour au numéro
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  • La pathologie cancéreuse pulmonaire à l’heure de l’intelligence artificielle : entre espoir, désespoir et perspectives
  • Simon Heeke, Hervé Delingette, Youta Fanjat, Elodie Long-Mira, Sandra Lassalle, Véronique Hofman, Jonathan Benzaquen, Charles-Hugo Marquette, Paul Hofman, Marius Ilié
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  • Pédagogie à grande échelle en ACP
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