L’incidence de la tuberculose maladie (TM) est globalement faible en France métropolitaine (7,1/100 000), mais variable selon les régions et l’origine géographique. Nous décrivons ici une épidémie clonale due à une souche de Mycobacterium tuberculosis Beijing/L2 au sein d’une communauté portugaise et cap-verdienne résidant sur une zone géographique limitée et ayant impacté plusieurs régions.

Les données sont issues des déclarations obligatoires et des enquêtes de dépistage réalisées par le CLAT concerné. Le suivi épidémiologique a été assuré et coordonné par l’ARS et la Cire. Trois cercles de dépistages ont été distingués :1)sujets vivant sous le même toit ; 2)contacts familiaux et amicaux proches ne vivant pas sous le même toit ; 3)contacts en collectivités d’enfants ou professionnels. Le spoligotypage et le séquençage complet des souches ont été réalisés par le laboratoire des Mycobactéries du CHU.

Entre juin 2017 et août 2018, 15 cas de TM et 21 cas d’ITL chez des enfants<15 ans ont été déclarés sur la zone épidémique ; auxquels s’ajoutent 45 ITL chez des adultes>15 ans. Sur les 27 enfants<15 ans du 1^er cercle dépistés, 9 ITL (33 %) et 5 TM (19 %, dont 2 méningites) ont été diagnostiqués. Sur les 13 enfants<15 ans du cercle 2 dépistés, 3 ITL (23 %) et 4 TM (23 %) ont été diagnostiqués. Dans le cercle 3, sur les 170 enfants<15 ans dépistés, 9 ITL ont été diagnostiquées (dont 7 sans autre source identifiée que le contact scolaire). Les dépistages ont été complets pour 90 % des enfants<15 ans, mais 1/3 des adultes>15 ans n’ont fait l’objet d’aucun dépistage. A ces cas, s’ajoutent 4 TM et 10 ITL<15 ans chez des contacts résidant dans deux autres régions. Le séquençage du génome complet de 11 souches de cas de la zone épidémique a confirmé qu’il s’agissait d’une chaîne unique de transmission due à une souche multisensible de la lignée Beijing/L2 ; et a permis de confirmer le cas index. Des analyses sur 3 souches provenant d’autres régions ont confirmé les liens épidémiologiques suspectés avec d’autres enquêtes précédentes ou en cours.

Cette épidémie clonale a mis en évidence des prévalences élevées de TM et ITL chez les contacts des 1^er et 2^e cercles, en particulier ceux<15 ans et une prévalence élevée d’ITL chez les contacts scolaires du 3^e cercle. Les difficultés de dépistage et de suivi et le caractère épidémiogène des souches Beijing/L2 pourraient expliquer en partie ces observations. Une surveillance renforcée se poursuit avec une attention particulière sur les rechutes ou l’éventuelle émergence d’une résistance.