Le microbiote intestinal a un impact prépondérant sur le métabolisme de l’hôte. Le rôle causal du microbiote dans l’induction de pathologies métaboliques a été démontré avec succès par le biais de transplantations fécales ou de colonisations ciblées de modèles murins. Il y a cependant un écart entre les perspectives attrayantes découlant de ces trouvailles (par exemple aide au diagnostic ou traitements innovants des maladies) et l’aspect purement descriptif des nombreux travaux basés sur des changements structurels du microbiote de souris liés à une prise de régimes expérimentaux riches en lipides. Dans ce bref article, je passe en revue quelques récents travaux démontrant l’importance de la composition du régime alimentaire, notamment pour les lipides, vis-à-vis des interactions hôte–microbes. Je commente également certains points sensibles de la recherche sur le microbiote intestinal dans le contexte des maladies métaboliques.

The gut microbiota is known to play an important role in regulating host metabolism. There is indeed an accumulating body of data that demonstrates the causative role of gut microbes in disease development. Bioactive molecules contributing to enhancing or preventing metabolic disorders have been identified and may help tracking persons at risks to develop disease or help setting up innovative intervention strategies. However, there is still a gap of knowledge between this great potential and the massive amount of purely descriptive data on the impact of high-calorie diets on changes affecting the microbiome in experimental models. In the present article, I highlight seminal studies showing that dietary composition has a major impact on host phenotypes and the gut microbial ecosystem in diet-induced obese mice. I also briefly comment on some critical aspects of performing research in the field.