La prévention des infections associées aux soins et la lutte contre la diffusion des bactéries multirésitantes (BMR) sont des objectifs majeurs de santé publique. Les laboratoires contribuent pleinement à la prise en charge de patients dont l’objectif est double. 1 : individuel de diagnostic et de traitement de l’infection. 2 : collectif de lutte contre la transmission croisée et la pression antibiotique. Les moyens contraints humains, matériels et architecturaux des structures de soins justifient un diagnostic rapide. Le délai d’obtention de l’antibiogramme, technique de référence, est en effet difficilement compatible avec les exigences parfois drastiques de confinement des patients porteurs et les risques écologiques liés à l’utilisation empirique des antibiotiques de derniers recours. Les méthodes phénotypiques (tests d’hydrolyse), immunologiques (détection antigéniques) ou génotypiques (détection moléculaire ciblée) sont autant d’approches que le microbiologiste doit maîtriser. Ses choix devront tenir compte des performances, du coût et de la possibilité d’utiliser ces tests 7 jours sur 7, voire 24 heures sur 24. Leur impact dépendra également de la fluidité des informations entre acteurs (cliniciens, biologistes, hygiénistes) au sein d’une structure idéalement intégrée. Les perspectives techniques (séquençage de nouvelle génération) et l’évaluation clinique de la contribution au final de ces tests constituent des challenges particulièrement intéressants pour l’avenir.

The prevention of the healthcare associated infections and the fight against the spread of multidrug resistance bacteria constitute two major challenges for the public health. Laboratories contribute significantly to a dual purpose : an individual objective to diagnose and to treat a putative infection, and a collective objective to prevent cross transmission and antibiotic pressure. Owing to the human, material and architectural means limitations in healthcare establishments, the implementation of rapid testing methods is required. Indeed, the delay to obtain the results of the reference method (i.e. the antibiogram) is not compatible with the putative drastic isolation measures and the dramatic ecological consequences associated with the empirical use of last resort antibiotics. The phenotypic (hydrolysis detection), immunologic (resistance antigen detection) or genotypic (targeted molecular detection) methods are different approaches with whom the microbiologists must deal with. The choice must be based on their intrinsic performances, cost and ability to be implemented 7 days a week or 24 hours a day. Their contribution will also depend on the smooth flow of the exchange of information between actors (clinicians - biologists - infection control practitioners) within an ideally integrated structure.The technical perspectives (next generation sequencing availability) and the clinical evaluation of the contribution of these tests are highly interesting challenges for the future.