Early tetrapodomorph biogeography: Controlling for fossil record bias in macroevolutionary analyses - 16/11/19
Biogéographie des premiers tétrapodomorphes : contrôle du biais d’enregistrement des fossiles dans les analyses de macroévolution
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Abstract |
The fossil record provides direct empirical data for understanding macroevolutionary patterns and processes. Inherent biases in the fossil record are well known to confound analyses of this data. Sampling bias proxies have been used as covariates in regression models to test for such biases. Proxies, such as formation count, are associated with paleobiodiversity, but are insufficient for explaining species dispersal owing to a lack of geographic context. Here, we develop a sampling bias proxy that incorporates geographic information and test it with a case study on early tetrapodomorph biogeography. We use recently-developed Bayesian phylogeographic models and a new supertree of early tetrapodomorphs to estimate dispersal rates and ancestral habitat locations. We find strong evidence that geographic sampling bias explains supposed radiations in dispersal rate (potential adaptive radiations). Our study highlights the necessity of accounting for geographic sampling bias in macroevolutionary and phylogenetic analyses and provides an approach to test for its effect.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Résumé |
Le registre fossile fournit des données empiriques directes pour la compréhension des patrons et processus macro-évolutifs. Il est bien connu que des biais inhérents à l’enregistrement fossile peuvent brouiller les analyses de ces données. Des variables de substitution des biais d’échantillonnage ont été utilisées comme covariables dans des modèles de régression pour vérifier la présence de tels biais. Des approximations comme le dénombrement des formations sont associées à la paléobiodiversité, mais elles sont insuffisantes pour expliquer la dispersion des espèces en raison d’un défaut de contexte géographique. Ici, nous élaborons un substitut de biais d’échantillonnage qui incorpore de l’information géographique, et nous le testons sur une étude de cas de biogéographie sur les premiers tétrapodomorphes. On utilise des modèles phylogéographiques bayésiens récemment développés et un nouvel arbre de synthèse des premiers tétrapodomorphes pour estimer les taux de dispersion et les localisations d’habitats ancestraux. Nous obtenons des preuves solides de ce que le biais d’échantillonnage géographique explique les radiations supposées dans le taux de dispersion (radiations adaptatives potentielles). Notre étude met l’accent sur la nécessité de tenir compte des biais de l’échantillonnage géographique dans les analyses macro-évolutives et phylogénétiques, et fournit une approche pour tester leur effet.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : Sampling bias, Fossil record, Biogeography, Phylogenetics, Macroevolution, Tetrapodomorph water–land transition
Mots clés : Biais d’échantillonnage, Registre fossile, Biogéographie, Phylogénétique, Macro-évolution, Sortie de eaux chez les Tétrapodomorphes
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