Étude des mutations somatiques tumorales du gène codant pour la protéine TIF1 gamma chez les patients présentant une dermatomyosite TIF1 gamma positive avec cancer associé - 20/11/19
Résumé |
Introduction |
Parmi les dermatomyosites (DM) celles qui sont associées à l’autoanticorps anti TIF1 gamma (TIF1g) sont également celles qui s’associent le plus fréquemment à un cancer (60 à 80 %). Une des hypothèses physiopathologiques intéresse la mutation potentielle de la protéine TIF1g sur le site tumoral. Celle-ci serait susceptible d’induire une réponse immunitaire via les néoantigènes produits conduisant par extension épitopique des formes mutées vers la forme normale, à la production d’autoanticorps anti TIF1g. L’objectif de ce travail était d’analyser l’exome des tumeurs des patients atteints de dermatomyosite TIF1g positive, à la recherche de mutations somatiques du gène TRIM33 codant pour la protéine TIF1g.
Matériel et méthodes |
Les critères d’inclusion étaient les suivants :
– DM avec sérologie TIF1g positive contrôlée par dot myosite Euroimmun, ±ALBIA,
– cancer associé documenté histologiquement,
– consentement éclairé signé (patients vivants).
Les patients donc les blocs de paraffine étaient indisponibles ont été exclus. Le séquençage à haut-débit a ciblé le gène TRIM33 et 8 autres gènes de partenaires protéiques impliqués dans l’oncogénèse (i.e. : CBX8, ELAC1, LDB1, SKIL, SMAD2, SMAD4, SOX2, TRIM24). L’analyse bio-informatique a été réalisée par 2 pipelines différents. Elle a concerné les variants exoniques non synonymes ainsi que les variants touchant les positions −2/+2 des sites canoniques d’épissage non retrouvés dans les tumeurs « témoins » (2 patients sans DM) et présentant un ratio allélique supérieur à 5 %.
Résultats |
Parmi les 20 patients inclus, l’ADN a été extrait en qualité et quantité suffisantes pour l’enrichissement et la constitution de la librairie pour 13 tumeurs (dont 2 issues du même patients). Trente-cinq variants correspondant aux critères de sélection ont été détectés dans le gène TRIM33. Après analyse visant à éliminer les artéfacts, une quinzaine de variants d’intérêt potentiel ont été retenus.
Discussion |
Ces premiers résultats étayent l’hypothèse de la présence d’une protéine TIF1g mutée dans les tumeurs des patients atteints de DM avec sérologie TIF1g positive. Toutefois, il reste à démontrer que les potentiels néopeptides résultants des mutations peuvent être présentés et induire une réponse immunitaire via une restriction HLA compatible.
Conclusion |
La mise en évidence de mutations somatiques du gène de la protéine TIF1g dans les tumeurs malignes de patients atteints de DM TIF1g positive constitue un 1er élément physiopathologique explicatif du lien fort entre DM et cancer, dans cette population de patients.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Anticorps anti TIF1gamma, Dermatomyosite
Plan
Vol 146 - N° 12S
P. A78 - décembre 2019 Retour au numéro
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