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Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018 - 24/05/20

Doi : 10.1016/j.mycmed.2020.100970 
A.-P. Bellanger a, F. Persat b, F. Foulet c, d, C. Bonnal e, I. Accoceberry f, C. Angebault c, d, A. Angoulvant g, h, O. Augereau i, E. Bailly j, F. Bert k, J. Bonhomme l, J.-P. Bouchara m, M.-E. Bougnoux n, o, P. Bourdeau p, B. Bouteille q, S. Brun r, K. Brunet s, A.-M. Camin-Ravenne t, S. Cassaing u, T. Chouaki v, M. Cornet w, D. Costa x, N. Desbois y, J. Dorin z, A. Fekkar aa, A. Fiacre ab, E. Fréalle ac, J.-P. Gangneux ad, J. Guillot d, ae, J. Guitard af, L. Hasseine ag, A. Huguenin ah, L. Lachaud ai, S. Larréché aj, R.-A. Lavergne ak, S. Le Gal al, Y. Le Govic m, V. Letscher-Bru am, M. Machouart an, E. Mazars ao, C. Nourrisson ap, A. Paugam aq, S. Ranque ar, V. Risco-Castillo d, ae, M. Sasso as, M. Sautour at, B. Sendid ac, au, Y. Senghor av, F. Botterel c, d, Eric Dannaoui d, aw,
a Hôpital Universitaire Jean Minjoz, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Besançon, France 
b Hospices Civils de Lyon, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Institut des Agents Infectieux Lyon 1, Lyon, France 
c Hôpital Universitaire Mondor, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Créteil, France 
d EA Dynamyc UPEC, EnvA, USC Anses, Faculté de Médecine de Créteil, 8, rue du Général Sarrail, 94010 Créteil, France 
e Hôpital Universitaire Bichat, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France 
f University Bordeaux, CNRS, Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, UMR 5234, CHU Bordeaux, 33000 Bordeaux, France 
g Service de Parasitologie-mycologie, Hôpital universitaire Bicêtre, APHP, Le Kremlin-Bicêtre, France 
h GQE Le Moulon, INRA, University Paris-Sud/Université ParisSaclay, CNRS, AgroParisTech, Orsay, France 
i Hôpitaux Civils de Colmar, laboratoire de Microbiologie, Colmar, France 
j Hôpital Universitaire Tours, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Tours, France 
k Hôpital Universitaire Beaujon, laboratoire de Microbiologie, Clichy, France 
l Hôpital Universitaire Caen, laboratoire de Microbiologie, Normandie Univ, UNICAEN, Caen, France 
m Hôpital Universitaire Angers, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Angers, France 
n Hôpital Universitaire Necker, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France 
o Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques, Institut Pasteur, 25, rue du Dr Roux, 75015 Paris, France 
p École Vétérinaire de Nantes-ONIRIS, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nantes, France 
q Hôpital Universitaire Dupuytren, Centre de biologie et de recherche en santé, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Limoges, France 
r Hôpital Universitaire Avicenne, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, AP-HP, Bobigny, France 
s Hôpital Universitaire Poitiers, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Inserm U1070, Université de Poitiers, France 
t Centre Hospitalier de Bigorre, laboratoire, Tarbes, France 
u Hôpital Universitaire Toulouse, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Toulouse, France 
v Hôpital Universitaire Amiens, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Amiens, France 
w University Grenoble Alpes, CNRS, CHU Grenoble Alpes, INP, TIMC-IMAG, 38000 Grenoble, France 
x Hôpital Universitaire de Rouen, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Rouen, France 
y Hôpital Universitaire de la Martinique, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Martinique, France 
z Service de Biologie, Centre Hospitalier d’Antibes Juan les Pins, Antibes, France 
aa Service de Parasitologie Mycologie; Sorbonne Université, Inserm, AP-HP, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, CNRS, Centre d’Immunologie et des Maladies Infectieuses, Cimi-Paris, 75013 Paris, France 
ab Laboratoire multi site d’analyses médicales, Meaux, France 
ac CHU Lille, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, 59000 Lille, France 
ad Hôpital Universitaire Rennes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Rennes, France 
ae École nationale vétérinaire d’Alfort, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, BioPôle Alfort, Maisons-Alfort, France 
af Sorbonne Université, Inserm, Centre de Recherche St Antoine, CRSA, AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, 75012 Paris, France 
ag Hôpital Universitaire de Nice, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nice, France 
ah Laboratoire de Parasitologie Mycologie, CHU de Reims, Hôpital Maison Blanche, 45, rue Cognacq Jay, 51092 Reims cedex, France 
ai Hôpital Universitaire de Montpellier, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Montpellier, France 
aj Hôpital d’instruction des armées Bégin, département de biologie médicale, Saint-Mandé, France 
ak Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Institut de Biologie, CHU de Nantes, Nantes, France 
al Groupe d’Etude des Interactions Hôte-Pathogène (EA 3142), Université de Brest-Université d’Angers, Hôpital Universitaire de Brest, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Brest, France 
am Hôpital Universitaire de Strasbourg, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Strasbourg, France 
an Hôpital Universitaire de Nancy, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nancy, France 
ao Centre Hospitalier de Valenciennes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Valenciennes, France 
ap Service de Parasitologie-Mycologie, CHU Gabriel Montpied, 3IHP, Clermont-Ferrand, France 
aq Hôpital Universitaire de Cochin, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Paris, France 
ar Aix Marseille Université, IHU Méditerranée Infection, IRD, AP-HM, SSA, VITROME, Marseille, France 
as Hôpital Universitaire de Nîmes, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Nîmes, France 
at Hôpital Universitaire de Dijon, laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Dijon, France 
au CHU Lille, Laboratoire de Parasitologie Mycologie, University Lille, Inserm U995 -LIRIC, Fungal Associated Invasive & Inflammatory Diseases, 59000 Lille, France 
av Groupement Hospitalier Paris Saint Joseph, laboratoire de Microbiologie, Paris, France 
aw Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Unité de Parasitologie-Mycologie, Université Paris Descartes, Paris, France 

Corresponding author at: Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Unité de Parasitologie-Mycologie, Paris, France.Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Unité de Parasitologie-MycologieParisFrance

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Abstract

A survey of mycology laboratories for antifungal susceptibility testing (AFST) was undertaken in France in 2018, to better understand the difference in practices between the participating centers and to identify the difficulties they may encounter as well as eventual gaps with published standards and guidelines. The survey captured information from 45 mycology laboratories in France on how they perform AFST (number of strains tested, preferred method, technical and quality aspects, interpretation of the MIC values, reading and interpretation difficulties). Results indicated that 86% of respondents used Etest as AFST method, with a combination of one to seven antifungal agents tested. Most of the participating laboratories used similar technical parameters to perform their AFST method and a large majority used, as recommended, internal and external quality assessments. Almost all the participating mycology laboratories (98%) reported difficulties to interpret the MIC values, especially when no clinical breakpoints are available. The survey highlighted that the current AFST practices in France need homogenization, particularly for MIC reading and interpretation.

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Keywords : Antifungal susceptibility testing, Etest, MIC value interpretation, Laboratory practice


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Vol 30 - N° 2

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  • J.-P. Gangneux, M.-E. Bougnoux, E. Dannaoui, M. Cornet, J.R. Zahar
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  • Anticandidal and synergistic effect of essential oil fractions from three aromatic plants used in Cameroon
  • M.N.L. Ngo-Mback, C. Babii, P.M. Jazet Dongmo, M.R. Kouipou Toghueo, M. Stefan, F. Fekam Boyom

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