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Bactéries émergentes dans la mucoviscidose et les dilatations des bronches hors mucoviscidose. Le point de vue du microbiologiste - 14/08/20

Emerging bacteria in cystic fibrosis and non-cystic fibrosis bronchiectasis from a microbiologist's perspective

Doi : 10.1016/j.rmr.2020.06.006 
Q. Menetrey a, C. Dupont b, R. Chiron c, H. Marchandin d,
a HydroSciences Montpellier, CNRS, IRD, université de Montpellier, Montpellier, France 
b HydroSciences Montpellier, CNRS, IRD, laboratoire d’écologie microbienne hospitalière, université de Montpellier, CHU de Montpellier, Montpellier, France 
c HydroSciences Montpellier, CNRS, IRD, centre de ressources et de compétences de la mucoviscidose, université de Montpellier, CHU de Montpellier, Montpellier, France 
d HydroSciences Montpellier, CNRS, IRD, département de microbiologie, université de Montpellier, CHU de Nîmes, Nîmes, France 

Auteur correspondant. UMR 5569 HydroSciences Montpellier, équipe pathogènes hydriques santé environnements, UFR des sciences pharmaceutiques et biologiques, université de Montpellier, 15, avenue Charles-Flahault, BP 14491, 34093 Montpellier cedex 5, France.UMR 5569 HydroSciences Montpellier, équipe pathogènes hydriques santé environnements, UFR des sciences pharmaceutiques et biologiques, université de Montpellier15, avenue Charles-Flahault, BP 14491Montpellier cedex 534093France

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Résumé

Introduction

La microbiologie du tractus respiratoire au cours de la mucoviscidose et des dilatations des bronches hors mucoviscidose (DDBHM) est dominée par certains pathogènes comme Pseudomonas aeruginosa. Toutefois, d’autres bactéries comme Achromobacter complexe xylosoxidans, Stenotrophomonas maltophilia et les mycobactéries non tuberculeuses sont actuellement considérées comme émergentes au cours de la mucoviscidose et sont également rapportées au cours des DDBHM.

État des connaissances

L’émergence de bactéries pathogènes opportunistes a été reconnue grâce au suivi national des données microbiologiques des patients atteints de mucoviscidose. Malgré l’existence de facteurs d’émergence bactérienne similaires, la création plus récente des registres de suivi des données microbiologiques au cours des DDBHM ne permet pas encore l’identification des bactéries émergentes au cours de ces pathologies.

Perspectives

Un suivi longitudinal des données microbiologiques est nécessaire au cours des DDBHM afin de reconnaître l’émergence de certaines bactéries. Une homogénéisation des pratiques d’analyse microbiologique des expectorations des patients permettrait également une comparaison rigoureuse des données obtenues pour les patients atteints de mucoviscidose et ceux atteints de DDBHM.

Conclusion

Diverses bactéries émergentes au cours de la mucoviscidose doivent faire l’objet d’un suivi dans les DDBHM compte tenu de leur rôle avéré dans la dégradation de la fonction pulmonaire.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Introduction

Common major pathogens like Pseudomonas aeruginosa are identified in the airways of patients with cystic fibrosis (CF) and non-CF bronchiectasis. However, other opportunistic bacterial pathogens like Achromobacter xylosoxidans complex, Stenotrophomonas maltophilia and non-tuberculous mycobacteria are currently emerging in CF and are also reported in non-CF bronchiectasis.

Background

The emergence of opportunistic bacterial pathogens has been recognized in CF through annual national reports of sputum microbiology data. Despite common factors driving the emergence of bacteria identified in CF and non-CF bronchiectasis patients, bronchiectasis registries have been created more recently and no longitudinal analysis of recorded microbiological data is currently available in the literature, thereby preventing the recognition of emerging bacteria in patients with non-CF bronchiectasis.

Outlook

A longitudinal follow-up of microbiological data is still needed in non-CF bronchiectasis to identify emerging opportunistic bacterial pathogens. Homogeneity in practice of sputum microbiological examination is also required to allow comparative analysis of data in CF and non-CF bronchiectasis.

Conclusion

Bacterial pathogens recognized as emerging in CF have to be more carefully monitored in non-CF bronchiectasis in view of their association with deterioration of the lung disease.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Mucoviscidose, Dilatation des bronches hors mucoviscidose, Bactéries émergentes, Pathogènes opportunistes, Examen cytobactériologique des crachats

Keywords : Cystic fibrosis, Non-cystic fibrosis bronchiectasis, Emerging bacteria, Opportunistic pathogens, Cytobacteriological sputum examination


Plan


 Ce texte a été rédigé à l’occasion de la communication d’H. Marchandin lors des 7e Journées du Groupe pour la recherche et l’enseignement en pneumo-infectiologie (GREPI) de la Société de pneumologie de langue française.


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Vol 37 - N° 7

P. 561-571 - septembre 2020 Retour au numéro
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