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Identification des moisissures au laboratoire de routine hospitalière - 10/02/21

Identification of molds in the routine laboratory

Doi : 10.1016/S1773-035X(21)00039-3 
Marion Blaize, Anne-Cécile Normand, Arnaud Fekkar, Renaud Piarroux
 Service de parasitologie-mycologie, hôpital de la Pitié-Salpêtrière, 47-83 boulevard de l'Hôpital, 75013 Paris, France 

*Auteur correspondant.

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Résumé

Résumé

La présence de moisissures en culture au laboratoire n’est pas rare et leur identification participe au diagnostic et à la prise en charge des patients. Les techniques d’identification des champignons filamenteux ont considérablement évolué depuis les années 2000 : à l’identification morphologique nécessitant une expertise importante se sont ajoutées des approches de biologie moléculaire basées sur la comparaison de séquences d’ADN ou de type Maldi-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization - Time of Flight) comparant des profils protéiques à des bases de données de plus en plus fournies. Ces nouvelles techniques bien que plus couteuses que l’identification morphologique, permettent des identifications robustes et même de décrire de nouvelles espèces ou complexes d’espèces. Toutefois des erreurs ne sont pas à exclure et le rôle des techniciens et biologistes au sein des laboratoires reste essentiel pour analyser, critiquer et interpréter les résultats obtenus par ces nouvelles technologies et les confronter au contexte clinique des patients.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Abstract

Positive mold culture in the medical laboratory is not uncommon and their identification contributes to the diagnosis and management of patients. Identification of filamentous fungi has evolved considerably since the 2000s, moving from morphological identification requiring importante expertise to molecular biology approaches based on the comparison of DNA sequences or Maldi-TOF protein profiles comparing to available databases. These new techniques, although more expensive than morphological identification, make it possible to be specific in the identification and even to describe new species or species complexes. However, errors cannot be ruled out and the role of technicians and biologists in laboratories remains essential to analyze, criticize and interpret the results obtained by these new technologies and confront them to the clinical context of patients.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : banque de données, identification, Maldi-TOF, moisissure, séquençage

Keywords : database, DNA sequencing, identification, Maldi-TOF, mold


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Vol 2021 - N° 529

P. 58-65 - février 2021 Retour au numéro
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