S'abonner

CRISPR-Cas13a mediated targeting of hepatitis C virus internal-ribosomal entry site (IRES) as an effective antiviral strategy - 19/02/21

Doi : 10.1016/j.biopha.2021.111239 
Muhammad Usman Ashraf a, c, 1, Hafiz Muhammad Salman a, 1, Muhammad Farhan Khalid a, Muhammad Haider Farooq Khan a, Saima Anwar b, Samia Afzal c, Muhammad Idrees c, Safee Ullah Chaudhary a,
a Biomedical Informatics Research Laboratory, Department of Biology, Lahore University of Management Sciences, Lahore, Pakistan 
b Department of Biomedical Engineering, University of Engineering and Technology, Lahore, Pakistan 
c Center of Excellence in Molecular Biology, University of the Punjab, Lahore, Pakistan 

Corresponding author.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

pages 7
Iconographies 4
Vidéos 0
Autres 0

Graphical abstract




Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Highlights

CRISPR effector Cas13a can be reprogrammed to target ssRNA virus in a eukaryotic system.
Cas13a is effective at targeting hepatitis C virus in cell culture.
Several of potential Cas13a target sites are present in HCV-IRES.
Optimal Cas13a target sites are identified via computational analysis.
Cas13a-based targeting of HCV-IRES can be used to develop broad genotypic therapeutics.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Hepatitis C is an inflammatory liver disease caused by the single-stranded RNA (ssRNA) hepatitis C virus (HCV). The genetic diversity of the virus and quasispecies produced during replication have resulted in viral resistance to direct-acting antivirals (DAAs) as well as impediments in vaccine development. The recent adaptation of CRISPR-Cas as an alternative antiviral approach has demonstrated degradation of viral nucleic acids in eukaryotes. In particular, the CRISPR-effector Cas13 enzyme has been shown to target ssRNA viruses effectively. In this work, we have employed Cas13a to knockdown HCV in mammalian cells. Using a computational screen, we identified several potential Cas13a target sites within highly conserved regions of the HCV internal ribosomal entry site (IRES). Our results demonstrate significant inhibition of HCV replication as well as translation in huh-7.5 cells with minimal effects on cell viability. These findings were validated using a multi-modality approach involving qRT-PCR, luciferase assay, and MTT cell viability assay. In conclusion, the CRISPR-Cas13a system efficiently targets HCV in vitro, suggesting its potential as a programmable therapeutic antiviral strategy.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : HCV IRES inhibition, CRISPR Cas13, CRISPRi, Antiviral treatment


Plan


© 2021  The Author(s). Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 136

Article 111239- avril 2021 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Diterpenoid anthraquinones as chemopreventive agents altered microRNA and transcriptome expressions in cancer cells
  • Ying-Shih Su, Min Zhan Kuo, Yi Ting Kuo, Shu-Wei Huang, Chia-Jung Lee, Zheng-Yuan Su, Yu-Hui Ni, Dian-Kun Li, Tien-Yuan Wu
| Article suivant Article suivant
  • Hepatoprotective effects of extracts, fractions and compounds from the stem bark of Pentaclethra macrophylla Benth: Evidence from in vitro and in vivo studies
  • Cyrille Lionel Kamga Bomgning, Pierre Valery Kemdoum Sinda, Beaudelaire Kemvoufo Ponou, Agathe Lambou Fotio, Mathias Kenfack Tsague, Borice Tapondjou Tsafack, Jonas Kühlborn, Elvine Pami Mbuyo-Nguelefack, Rémy Bertrand Teponno, Till Opatz, Léon Azefack Tapondjou, Télesphore Benoit Nguelefack

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’achat d’article à l’unité est indisponible à l’heure actuelle.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.