Des variants dans un nombre croissant de gènes sont impliqués dans les paraparésies spastiques héréditaires (PSH). Le séquençage haut débit de panels multi-gènes permet leur étude ciblée en un temps.

Cette étude avait pour objectif de décrire le taux de résolution diagnostique et la distribution des gènes causaux identifiés avec notre panel de gènes.

Les résultats des cas index PSH testés entre décembre 2013 et juillet 2019 avec le panel de gènes développé à l’institut du cerveau et utilisé à l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière (Paris, France) ont été récupérés. La version initiale du panel couvrait 65 gènes. Le caractère causal des variants était déterminé suivant les critères ACMG et leur présence confirmée par une deuxième analyse ciblée (Sanger ou MLPA).

Le gène causal a été identifié chez 472/1550 patients (30,5 %) parmi 35 des 65 gènes analysés. Un variant supplémentaire a été identifié avec l’ajout de 7 gènes pour les 373 derniers patients testés. Les gènes les plus fréquemment retrouvés étaient de transmission autosomique dominante (60,4 %) avec SPAST (9,1 % des patients), KIF1A (2,2 %) et ATL1 (2,2 %) et récessive (39,4 %) avec SPG7 (4,8 %) et SPG11 (1,7 %). Les variants structuraux représentaient 6,0 % des variants pathogènes (1,9 % des patients).

Il s’agit de la plus grande série validant les performances diagnostiques courantes d’un panel de gènes dans les PSH. L’étude d’un grand nombre de gènes en une analyse facilite la mise en évidence de gènes rares et variés. La couverture de séquençage optimisée permettait la détection de variants structuraux, critique en raison de leur proportion non négligeable.

Les panels sont performants comme première exploration génétique des PSH. La connaissance de la répartition des gènes causaux va permettre de renforcer la recherche sur les formes affectant le plus grand nombre de patients.