Apprécier la réalité histo-architecturale in vivo des noyaux gris centraux notamment des thalami est un véritable challenge en imagerie. La définition précise de cette anatomie est cependant un prérequis nécessaire pour mesurer avec précision des altérations structurales parenchymateuses ou réaliser le ciblage stéréotaxique en neurochirurgie [1Bazin P.-L., Pham D.L. Homeomorphic brain image segmentation with topological and statistical atlases Med Image Anal 2008 ;  12 : 616-62510.1016/j.media.2008.06.008 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références].

Des images tridimensionnelles MP2RAGE (Magnetization Prepared with two Rapid Acquisition Gradient Echoes sequence) [2Marques J.P., Kober T., Krueger G., van der Zwaag W., Van de Moortele P.-F., Gruetter R. MP2RAGE, a self bias-field corrected sequence for improved segmentation and Neuroimage 2010 ;  49 : 1271-128110.1016/j.neuroimage.2009.10.002 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références] ont été acquises en 0,6mm isotropique à 7T chez 60 volontaires sains. Une méthode de normalisation « group-wize » [3Avants B.B., Epstein C.L., Grossman M., Gee J.C. Symmetric diffeomorphic image registration with cross-correlation: evaluating automated labeling of elderly and neurodegenerative brain Med Image Anal 2008 ;  12 : 26-4110.1016/j.media.2007.06.004 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références] a permis de créer un template T1 haute résolution (0,5mm³) à partir de 30 des 60 sujets (Fig. 1). Deux neuroradiologues (R1 et R2) ont réalisé une segmentation de 24 régions de substance gris profonde et de douze noyaux thalamiques dans chaque hémisphère, selon l’atlas de Morel [4Morel A., Magnin M., Jeanmonod D. Multiarchitectonic and stereotactic atlas of the human thalamus J Comp Neurol 1997 ;  387 : 588-63010.1002/(sici)1096-9861(19971103)3874<588::aid-cne8>3.0.co;2-z.  [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références]. Un atlas moyenné (7TAMIbrainDGN) à partir des deux segmentations a été validé par un troisième neuroradiologue (Fig. 2). Les structures correspondantes ont également été extraites à partir de deux autres atlas numériques (e-Morel et CIT168). Les valeurs quantitatives moyennes absolues des temps de relaxation T1 ont été ensuite extraites après correction du B1+. Un score de Dice a été calculé pour mesurer la concordance inter-observateur et la variabilité inter-atlas.

Les scores de Dice entre les deux neuroradiologues, entre le R1 et 7TAMIbrainDGN et entre R2 et 7TAMIbrainDGN étaient respectivement de 0,74±0,13, 0,87±0,07, 0,86±0,08. Les Dice entre 7TAMIbrainDGN et l’atlas e-Morel étaient de 0,53±0,16 et de 0,80±0,07 entre 7TAMIbrainDGN et CIT168. Les temps de relaxation T1 variaient de 1322 ms à 2003 ms.

Cette étude a permis de créer un atlas des noyaux gris centraux et des thalamis à 7T et de valider un processus de segmentation automatisé avec extraction des temps de relaxation T1.