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Sampling strategy for bacteriological diagnosis of intrathoracic tuberculosis - 11/06/21

Doi : 10.1016/j.resmer.2021.100825 
T. Maitre a, b, , V. Ok a, b, F. Morel a, b, I. Bonnet a, b, W. Sougakoff a, b, J. Robert a, b, V. Trosini c, E. Caumes d, A. Aubry a, b, N. Veziris a, b, e
a Laboratoire de bactériologie-hygiène, centre national de référence des mycobactéries et de la résistance des mycobactéries aux antituberculeux, groupe hospitalier, Sorbonne Université, Site Pitié-Salpêtrière, AP–HP, Paris, France 
b Inserm U1135, Sorbonne université, centre d’immunologie et des maladies infectieuses (CIMI-Paris), Paris, France 
c Service de pneumologie, médecine intensive et réanimation, département R3S, groupe hospitalier, Sorbonne université, Site Pitié-Salpêtrière, AP–HP, Paris, France 
d Service de maladies infectieuses et tropicales, groupe hospitalier, Sorbonne université, Site Pitié Salpêtrière, AP–HP, Paris, France 
e Département de bactériologie, groupe hospitalier, Sorbonne université, site Saint-Antoine, AP–HP, Paris, France 

Corresponding author.

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Abstract

Background

Pulmonary tuberculosis (TB) is the most frequent site of TB and the one leading its spread worldwide. Multiple specimens are commonly collected for TB diagnosis including those requiring invasive procedures. This study aimed to review the sampling strategy for the microbiological diagnosis of pulmonary TB.

Methods

A retrospective analysis of collected samples from September 1st 2014 to May 1st 2016 in the Bacteriology laboratory of Pitié-Salpêtrière Hospital (Paris, France) was performed. All the samples collected in patients aged over 18 years for the bacteriological diagnosis of pulmonary TB were included.

Results

A total of 6267 samples were collected in 2187 patients. One hundred and twenty-six patients (6%) had a culture confirmed pulmonary TB. Among them, multiple sputum collections were sufficient for TB diagnosis in 63.5%, gastric lavages permitted to avoid bronchoscopy in only 7.1%, and bronchoscopy was necessary in 29.4%. The culture positivity of sputa (8.6%) was higher than that of bronchial aspirations (3.1%), bronchiolo-alveolar lavages (BAL) (2.3%) or gastric lavages (4.8%) (P<0.001). From its 70.0% theoretical PPV value, the 46.1% selection in bronchial aspirations allocated to molecular test increased PPV up to 88.9%.

Conclusions

Based on our data, we suggest to collect sputum consistently. If smear negative a bronchoscopy should be performed and molecular diagnosis be performed on a subset of bronchial aspirations based on expertise of the bronchoscopist.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Tuberculosis, Diagnosis, Pumonary


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