La microtomographie computérisée aux rayons X (microCT), développée depuis la fin des années 1990, est une version miniaturisée des scanners utilisés quotidiennement en imagerie médicale. Elle permet de réaliser des images vasculaires différentes de celles obtenues par microradiographie, notamment en facilitant la vision dans l’espace et donc la compréhension de la microvascularisation. Les pièces anatomiques une fois formolées sont injectées avec un mélange gélatine–produit de contraste (baryum) puis analysées par microCT avec des durées de traitement qui peuvent dépasser 24H et des filtres métalliques variables selon l’objet. Les images de projections sont reconstruites de façon à produire des coupes 2D. Celles-ci sont utilisées pour la reconstruction de modèles 3D à l’aide de logiciels de rendu de volume.

Quatre exemples vont permettre de visualiser la microvascularisation : nerf alvéolaire inférieur, cortex cérébral et pie-mère, tronc cérébral, noyaux gris centraux (ganglions de la base du cerveau). De petits capillaires sont mis en évidence en utilisant des logiciels haut de gamme pour la reconstruction. Les logiciels conventionnels entraînent des pertes d’information sur les petits vaisseaux qui ne sont pas visualisés. Les logiciels permettent la réalisation de vidéos particulièrement utiles pour l’exploration 3D et l’enseignement.