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Genetic diversity and expression profile of Plasmodium falciparum Pf34 gene supports its immunogenicity - 10/11/21

Doi : 10.1016/j.retram.2021.103308 
Sri Krishna a, Sneha Bhandari a, Anup Kumar Vishwakarma a, Anil Kumar Verma a, Mrigendra P. Singh b, Anjana Sharma c, Neeru Singh a, 1, Praveen K. Bharti a,
a ICMR-National Institute of Research in Tribal Health, Jabalpur, Madhya Pradesh 482003, India 
b ICMR-National Institute of Malaria Research, field station, Jabalpur, Madhya Pradesh 482003, India 
c Department of Biological Sciences, Rani Durgavati Vishwavidyalaya, Jabalpur, Madhya Pradesh 482001, India 

Corresponding author.

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Abstract

Purpose of the study

Genetic variation is one of the major obstacles in the development of effective vaccines. A multivalent malaria vaccine is required to increase efficacy and confer long term protection. In this context, we analysed the genetic diversity, expression profile, and immune response against Pf34.

Methods

Phylogenetic analysis was carried out using Pf34 orthologues sequences of various Plasmodium species. Genetic diversity was analysed by PCR amplification and Sanger dideoxy sequencing of Pf34 gene from Plasmodium falciparum positive human blood samples. The expression level of Pf34 gene was studied during erythrocytic stage by real time qPCR at four-hour interval, and immune response against synthetic peptides of Pf34 (P1 and P2) was analysed using ELISA.

Results

Phylogenetic analysis revealed the conserved nature of Pf34 gene. Genetic diversity analysis showed that majority (92%) of Plasmodium falciparum isolates in available database bore wild type Pf34 gene (Hd = 0.160 ± 0.030, π = 0.00021), including the present study (89.3%). The P. falciparum specific amino acid repeats (NNDK, NNDLK, and NNNNNN) in the B cell epitope regions were conserved. Furthermore, Pf34 gene is expressed throughout the erythrocytic cycle and comparatively high expression was observed in early ring and schizont stage. High IgG response was observed against both the peptides P1 and P2 of Pf34 containing asparagine NNNNNN and NNDLK repeat respectively.

Conclusion

The limited genetic diversity, presence of conserved amino acid repeats within B cell epitope and high IgG response suggests that Pf34 may be a potential vaccine candidate for malaria. However, further validation studies are required.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Plasmodium falciparum, Pf34, Amino acid repeat, Genetic diversity, Expression


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Vol 69 - N° 4

Article 103308- octobre 2021 Retour au numéro
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