S'abonner

Faisabilité et utilité clinique d’une recherche systématique de transcrits de fusions oncogéniques par technique nCounter® (Nanostring) dans les cancers bronchiques non à petites cellules sans altérations moléculaires oncogéniques détectées au NGS sur ADN - 25/12/21

Doi : 10.1016/j.rmra.2021.11.548 
O. Valet 1, C. Masson 2, M. Barritault 3, L. Chalabreysse 4, M. Darrason 5, L. Kiaoukouma-Maleka 6, G. Devouassoux 7, J.F. Mornex 8, S. Couraud 9, P.P. Bringuier 2, M. Duruisseaux 10,
1 Service de Pneumologie, Hôpital Louis Pradel, Hospices Civils de Lyon Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France 
2 Service de Biopathologie moléculaire, Hospices Civiles de Lyon, Université Claude Bernard 1, Lyon, France 
3 Service de Biopathologie moléculaire, Hospices Civiles de Lyon, Lyon, France 
4 Service d’anatomie et de cytologie pathologiques, Hôpital Louis Pradel, Hospices Civils de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France 
5 Service de Pneumologie Aigue et Cancérologie Thoracique, Hôpital Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, Institut de Recherches Philosophiques de Lyon, Université Lyon 3, Lyon, France 
6 Service de Pneumologie Hôpital Croix Rousse, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France 
7 Service de Pneumologie Hôpital Croix Rousse, Hospices Civils de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France 
8 Service de Pneumologie, Hôpital Louis Pradel, Hospices Civils de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France 
9 Service de Pneumologie Aigue Spécialisée et cancérologie Thoracique, Hôpital Lyon Sud, Hospices Civils de Lyon, 69310, Pierre Bénite, Lyon, France 
10 Service de Pneumologie, Hôpital Louis Pradel, Hospices Civils de Lyon URCOT, Hospices Civils de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France 

Auteur correspondant.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
Article gratuit.

Connectez-vous pour en bénéficier!

Résumé

Introduction

Un diagnostic moléculaire systématique est recommandé dans les cancers bronchiques non à petites cellules (CBNPC) métastatiques. Le séquençage ciblé de l’ADN par Next Generation Sequencing (NGS-ADN) est la technique la plus fiable pour détecter les mutations oncogéniques. Une autre technique est souvent nécessaire pour les fusions oncogéniques. L’objectif de cette étude est d’évaluer la faisabilité et l’intérêt clinique d’un diagnostic moléculaire systématique des fusions sur ARN tumoral par technique nCounter ® (Nanostring) dans les CBNPC sans mutation au NGS-ADN.

Méthodes

Tous les échantillons de CBNPC diagnostiqués aux Hospices Civils de Lyon de mars 2019 à mars 2020 et séquencés en routine par NGS-ADN (IonTorrent ®, Thermofischer) étaient identifiés. Les échantillons négatifs pour les mutations EGFR/KRAS/BRAF/HER2/METex14 et IHC ALK négatif et avec matériel disponible bénéficiaient d’une recherche de fusions ALK/RET/ROS1/NTRK1/NRG1 par nCounter ® sur ARN et représentaient la population étudiée. Le critère d’évaluation principal était le temps médian en jours ouvrés (TJO) entre la réalisation du prélèvement tumoral et la communication au clinicien du compte-rendu (CR) du diagnostic moléculaire comprenant les fusions.

Résultats

619 échantillons étaient analysés par NGS-ADN. 124 échantillons négatifs en NGS-ADN étaient analysés par nCounter ® et inclus. L’âge médian était 66 ans, 75 % étaient des hommes, 25 % étaient des femmes, 84 % étaient fumeurs, 80 % étaient des adénocarcinomes, 68 % des stades IV. Le TJO entre réalisation du prélèvement et CR avec fusions était de 17 (9–57). Le TJO entre réalisation du prélèvement et CR du NGS-ADN était de 11 (5–34). Une fusion était retrouvée dans 11% (14/124) des cas. Parmi les CBNPC métastatiques (n=68), une fusion (ROS1=4, ALK=5, RET=3, NTRK1=2) était identifiée chez 8 patients dont 6 ont reçu un inhibiteur adapté en première ligne. La médiane de survie sans progression (SSP) en première ligne de traitement en cas de fusion était non atteinte et statistiquement plus longue que la médiane de SSP en première ligne de traitement en l’absence de fusion (112jours) (p=0,0027, log rank).

Conclusion

La recherche systématique de fusions oncogéniques par nCounter ® dans les CBNPC sans mutation détectée au NGS-ADN est accessible en routine dans un délai compatible avec l’activité clinique. Cette stratégie identifie des patients avec fusion oncogénique pouvant avoir un bénéfice clinique important avec des inhibiteurs adaptés.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Plan


© 2021  Publié par Elsevier Masson SAS.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 14 - N° 1

P. 59-60 - janvier 2022 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Augmentation des délais de prise charge du cancer du poumon pendant la pandémie COVID-19 : expérience d’un centre de diagnostic rapide ambulatoire
  • P. Wang, F. Millet, A. Canelas, V. Fallet, T. Makaon, D. Moal, D. Mourlon, A. Martine, J. Cadranel, A. Parrot, A. Lavole
| Article suivant Article suivant
  • Mise en place d’un centre de vaccination antiCOVID-19 dans le service de pneumologie et d’oncologie thoracique : retour d’expérience
  • L. Kech, G. Fatima, N. Selmane, K. Traore, B. Santel, S. Minier, A. Lavolé

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.