Près des trois-quarts des épilepsies sont en lien avec une anomalie génétique. Les formes les plus fréquentes d’épilepsie ont une origine génétique complexe, multigénique ou multifactorielle pour laquelle il reste beaucoup d’inconnues (les épilepsies dites idiopathiques ou présumées génétiques). Avec les progrès de la biologie moléculaire, les épilepsies monogéniques représentent une part de plus en plus importante des épilepsies. Nous discutons ici l’intérêt et les implications du diagnostic génétique pour le suivi des patients épileptiques, leur prise en charge et aussi pour la recherche thérapeutique. En cas d’épilepsie sévère, associée à une déficience intellectuelle, le diagnostic est primordial pour le conseil génétique, et parfois pour aider de manière tangible dans le choix des molécules anti-crises, et, probablement, pour la thérapie génique. En cas d’épilepsie focale pharmacorésistante, la mise en évidence de certaines anomalies génétiques est importante car elle peut contre-indiquer un geste chirurgical. En France, la plupart des équipes explorent les patients suspects d’épilepsie monogénique avec une analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA) et le panel des épilepsies monogéniques (PAGEM) en première intention. Ce panel, dont le nombre de gènes évolue en fonction des connaissances, a un rendement de 10 à 50 % selon l’âge de début et le type d’épilepsie. C’est un outil diagnostique performant et source de nombreux travaux de recherche collaboratifs en France. Lorsque le PAGEM et l’ACPA sont négatifs, les outils de nouvelle génération sont employés, en particulier l’étude du génome via la pré-indication « épilepsies précoces et sévères ».

Almost three quarters of epilepsies are related to a genetic abnormality. The most frequent forms of epilepsy have a complex, multigenic, or multifactorial genetic origin for which there are still many unknowns (the so-called idiopathic epilepsies). With the progress of genetics, monogenic epilepsies represent an increasing part of pediatric epilepsy. Here, we discuss the value and implications of genetic diagnosis for the follow-up and management of epileptic patients as well as for therapeutic research. In case of severe epilepsy, associated with an intellectual disability, the diagnosis is essential for genetic counseling, and is sometimes needed to help in a tangible way in the choice of anti-seizure medications, and probably also for gene therapy. In case of drug-resistant focal epilepsy, the detection of certain genetic abnormalities may contraindicate a surgical procedure and it is therefore important to have this information. In France, most teams examine patients suspected of having monogenic epilepsy with array-based comparative genomic hybridization (CGH) and the Panel of Monogenic Epilepsies (PAGEM) as a first-line test. This panel, whose number of genes evolves according to current knowledge, has a diagnostic yield of 10–50% depending on the age at onset and the type of epilepsy. It is a powerful diagnostic tool and the source of many collaborative research projects in France. When PAGEM and ACPA test results are negative, next-generation sequencing tools are used, in particular whole-exome and whole-genome sequencing, opening new perspectives in terms of diagnosis and knowledge regarding the genetics of epilepsy.