Le genre Ochrobactrum comporte deux espèces d'intérêt médical, Ochrobactrum anthropi et Ochrobactrum intermedium. Ce sont des bactéries de l'environnement de plus en plus fréquemment isolées en clinique humaine en particulier chez des patients immunodéprimés et lors d'infections nosocomiales. Les critères phénotypiques d'identification d'espèce sont mal définis, ce qui conduit à une mauvaise évaluation du rôle de chaque espèce en clinique. Par séquençage de l'ADN ribosomal 16S, nous avons identifié au niveau de l'espèce 20 isolats cliniques d'Ochrobactrum sp. Nous avons alors étudié les caractères phénotypiques de chaque isolat, en particulier la morphologie, la culture sur divers milieux et dans diverses conditions de température, les caractères biochimiques et le profil de résistance aux antibiotiques. L'aspect des colonies sur milieux Trypticase-Soja et McConkey, la culture à 45 °C sur milieu Trypticase-Soja, la présence d'une uréase, la résistance à la nétilmicine, la tobramycine et la colistine permettent de différencier les espèces. Le ribotypage par les endonucléases HindIII et EcoRI donne un critère de plus pour l'affiliation à une espèce mais ne permet pas un suivi épidémiologique. Par contre, l'électrophorèse en champ pulsé met en évidence un fort polymorphisme entre souches de la même espèce et détecte les souches clonales. Cette technique est donc un outil performant pour des études d'épidémiologie moléculaire sur les bactéries du genre Ochrobactrum.

Two species of medical interest belong to the genus Ochrobactrum, Ochrobactrum anthropi and Ochrobactrum intermedium. They are members of the microbiota of soil and an increasing number of works report the isolation of O. anthropi from clinical specimen, especially from immunocompromised patients and nosocomial infection. Involving of each species in human infection is poorly estimated due to unclear differential phenotypic characters. We performed 16S rDNA sequencing for identification of 20 clinical isolates of Ochrobactrum sp. to the species level. Then, we studied the phenotype of each isolate especially, morphology, culture onto different media and at different temperatures, biochemical characters and antibiotics resistance pattern. Colony morphology after growth onto Trypticase-Soy and McConkey agar, culture at 45 °C onto Trypticase-Soja agar, presence of urease, and netilmycin, tobramycin and colistin resistance allowed identification of species. Ribotyping using HindIII and EcoRI gave a supplementary criterion for species determination but did not allow typing at the infra-species level. In contrast, Pulsed-Field Gel Electrophoresis showed high degree of polymorphism between strains and proved the clonality of certain isolates. Thus, this method could be a useful tool for molecular epidemiology of Ochrobactrum infections.