Le tube digestif étant le système qui permet l'assimilation (digestion et absorption) des aliments ingérés, il est attendu, et avéré, que ses atteintes organiques, par exemple postopératoires (grêle court, chirurgie bariatrique), puissent occasionner un retentissement nutritionnel plus ou moins important. Les pathologies digestives fonctionnelles, et notamment le syndrome de l'intestin irritable, entretiennent également un lien, plus ou moins fort, avec l'alimentation. Les modifications récentes des produits alimentaires proposés par l'industrie agroalimentaire pourraient générer, en plus des pathologies métaboliques, une augmentation des intolérances fonctionnelles. Cette synthèse se propose de faire le point sur ces deux aspects différents mais complémentaires. Les pathologies digestives et pancréatiques, à l'exclusion de celles hépatobiliaires, seront considérées.