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Autophagy genes (HMGB1, Bcl2, Bax) fold change expression in cadaveric heart tissue to estimate time since death: A unique approach - 27/03/24

Expression des gènes de l’autophagie (HMGB1, Bcl2, Bax) dans le tissu cardiaque cadavérique pour estimer le temps écoulé depuis le décès : une approche unique

Doi : 10.1016/j.medleg.2023.100423 
Sahil Thakral a, Purvi Purohit b, Anupama Modi c, Richa Mishra d, Arvind Sinha e, Puneet Setia f,
a Department of Forensic Medicine and Toxicology, All India Institute of Medical Sciences, 151001 Bathinda, Punjab, India 
b Department of Biochemistry, All India Institute of Medical Sciences, 342005 Jodhpur, Rajasthan, India 
c School of applied sciences and Technology, Gujarat Technological University, 382424 Ahmedabad, Gujarat, India 
d Department of Transfusion Medicine and Blood Bank, All India Institute of Medical Sciences, 151001 Bathinda, Punjab, India 
e Department of Paediatric Surgery, All India Institute of Medical Sciences, 342005 Jodhpur, Rajasthan, India 
f Department of Forensic Medicine and Toxicology, All India Institute of Medical Sciences, 342005 Jodhpur, Rajasthan, India 

Corresponding author.

Summary

Estimation of time since death (TSD) is one of the most challenging aspects of forensic medicine. There are several methods used to estimate the TSD like physicochemical, entomological, biochemical, metabolic, autolytic, and physical methods, which provide a wide range of TSD, as they are affected by different factors, and these methods are always questionable. The approach behind the present study is to calculate the accurate TSD by using the fold change expression (FCE) of autophagy genes HMGB1, Bcl2, and Bax. Seventeen cadaver heart tissues were analyzed within a time frame of 0, 6, and 12hours from the TSD, at different time intervals at room temperature. FCE was determined and the mean cycle threshold (Ct) values obtained were assessed using RT-PCR. FCE of HMGB1 by ΔΔCt method at different time intervals showed that FCE was upregulated in the first 6–9hours after death and then almost stable till 15–18hours and then again showed upregulation up to 24hours after death. The Bcl2 and Bax show no FCE in the heart tissue at any point of time till 24hours after death. FCE of HMGB1 can be used to determine PMI and can be useful for PMI estimation. However, Bcl2 and Bax showed no expression till 24hours after death. These genes may be a reliable marker for determining the time since death in medico-legal cases, making the investigation of such new methodologies unique in their precision and objectivity in measuring PMI.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Autophagy, Bcl2, Bax, Fold change expression, Forensic genetics, HMGB1, Time since death


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