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Molecular Classification System for Cardiac Allograft Rejection is positively associated with the pathology severity of rejection - 08/01/26

Doi : 10.1016/j.acvd.2025.10.053 
G. Coutance 1, , A. Giarraputo 2, J. Patel 3, M. Fedrigo 4, S. Varnous 1, J.-P. Duong 5, J. Dagobert 6, P. Rouvier 7, P. Leprince 1, P. Achouh 8, X. Jouven 9, P. Bruneval 10, A. Angelini 11, J. Kobashigawa 12, A. Loupy 13
1 Chirurgie cardiaque, hôpitaux universitaires Pitié-Salpêtrière–Charles-Foix, Paris, France 
2 Paris Transplant Group, Inserm, Paris, France 
3 Heart transplantation, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, United States of America 
4 Cardiovascular pathology, University Padu, Padova, Italy 
5 Anatomopathologie, hôpital Necker, AP–HP, Paris, France 
6 Paris Transplant Group, Paris Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC) - Inserm - Université Paris Cité, Paris, France 
7 Anatomopathologie, hôpitaux universitaires Pitié-Salpêtrière–Charles-Foix, Paris, France 
8 Chirurgie cardiaque, HEGP, 20, rue Leblanc, Paris, France 
9 Cardiologie, hôpital européen Georges-Pompidou, AP–HP, Paris, France 
10 Anatomopathologie, hôpital européen Georges-Pompidou, AP–HP, Paris, France 
11 Paris Transplant Group, Inserm, Paris, France 
12 Heart transplantation, Cedars-Sinai Medical Center, 8700, Beverly boulevard, 90048 Los Angeles, CA, United States of America 
13 Transplantation rénale, hôpital Necker, AP–HP, Paris, France 

Corresponding author.

Résumé

Introduction

Targeted molecular profiling combined with reproducible formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) EMB-based technology has the potential to support cardiac rejection diagnosis.

Objective

We aimed to develop and validate targeted gene expression diagnostic models of cardiac rejection and show their association with ISHLT pathological grades.

Method

We built a multicenter cohort of 591 FFPE-EMBs collected from four international centers between 2011 and 2021. Biopsies were graded according to the ISHLT working formulations, including 188 AMR cases, 289 ACR cases, and 114 non-rejection cases, randomly split in a derivation ( n = 475) and a validation cohort ( n = 116). Tissue gene expression was analyzed on FFPE-EMB using the Banff Human Organ Transplant gene set. Molecular classifiers for AMR and ACR were built using a supervised model. Association between molecular scores and pathology severity of rejection were analyzed in both derivation and validation set.

Results

The derivation included a total of 151 AMR (pAMR1H+: n = 46, pAMR1I+: n = 36, pAMR2-3: n = 69), 232 ACR (ACR 1R: n = 143, ACR 2-3R: n = 89) and 92 non-rejection cases. The validation set included a total of 37 AMR (pAMR1H+: n = 12, pAMR1I+: n = 15, pAMR2-3: n = 10), 57 ACR (ACR 1R: n = 31, ACR 2-3R: n = 26) and 22 non-rejection cases. Median AMR scores in AMR, ACR and non-rejection cases were 0.655 (IQR = 0.316), 0.217 (IQR = 0.254) and 0.140 (IQR = 0.209), respectively. Median ACR scores in ACR, AMR and non-rejection cases were 0.678 (IQR = 0.347), 0.263 (IQR = 0.364) and 0.302 (IQR = 270), respectively. AMR and ACR molecular scores were strongly associated with the pathology assessment of severity of rejection according to AMR and ACR international working formulations, respectively (derivation set: ACR: P for trend = 1.017E-46, AMR: P for trend = 2.911E-52; validation set: ACR: P for trend = 1.827E-13, AMR: P for trend = 5.174E-10, Fig. 1 ). Molecular AMR score was not associated with ACR severity; neither was the ACR molecular score with AMR severity.

Conclusion

Tissue-based molecular diagnostic system developed closely aligned with histological grading of cardiac allograft rejection, enhancing diagnostic precision, and offering a reliable companion tool for routine practice.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

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