Pharmacogenomics aims at molecular subsetting of patients for more effective therapy. Transcriptomic profiling of the 60 human cancer cell lines (the NCI-60) used by the US National Cancer Institute serves that aim because the cells have been treated with   chemical compounds over the last 13 years. Patterns of potency can be mapped into molecular structures of the compounds or into molecular characteristics of the cells. We discuss conceptual and experimental aspects of the profiling, as well as a number of bioinformatic computer programs that we have developed for biological interpretation of the profiles. To cite this article: J.N. Weinstein, Y. Pommier, C. R. Biologies 326 (2003).

Un des objectifs de la pharmacogénomique est d'identifier des groupes de patients afin d'augmenter l'efficacité thérapeutique. Le profilage transcriptomique des 60 lignées cellulaires de l'Institut national du cancer des États-Unis répond à cet objectif, car la réponse de ces cellules à plus de 100000 agents chimiques et chimiothérapeutiques a été caractérisée depuis 13 ans. Les profils de réponse peuvent être répertoriés en fonction des structures des agents chimiques et des caractéristiques moléculaires des cellules. Nous discutons les aspects conceptuels et expérimentaux appliqués au profilage, ainsi que les différents logiciels bioinformatiques que nous avons développés pour l'interprétation biologique de ces profilages. Pour citer cet article : J.N. Weinstein, Y. Pommier, C. R. Biologies 326 (2003).