LNCIB has been producing a variety of human full-length-enriched, normalized and subtracted cDNA libraries from various cell lines and tissues in different developmental stages by using the CAP-Trapper method. By sequencing 23000 clones of these libraries we identified a pool of about 5800 good quality unique cDNAs. After BLAST analysis on Human RefSeq/Unigene databases, 1717 of these sequences remained with no or poor annotation. We show that cross-species comparative BLAST resulted as a valid tool for the annotation of orthologous genes. To cite this article: E. Dalla et al., C. R. Biologies 326 (2003).

Le LNCIB a produit un grand nombre de banques d'ADNc humains enrichies en clones de pleine longueur, normalisées et soustraites, à partir d'une variété de lignées cellulaires et de tissus à différents stades de développement, en utilisant la méthode CAP-Trapper. En séquençant 23000 clones de ces banques, nous avons identifié un pool d'environ 5800 ADNc uniques de bonne qualité. Après analyse par BLAST vis-à-vis des bases de données RefSeq/Unigene, 1717 de ces séquences sont restées dépourvues d'annotation significative. Nous montrons que l'utilisation des comparaisons par BLAST à travers les espèces se révèle un outil valide pour l'annotation des gènes orthologues. Pour citer cet article : E. Dalla et al., C. R. Biologies 326 (2003).