Small open reading frames in untranslated regions of mRNAs - 01/01/03
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Résumé |
Using the 
-end sequence data from oligo-capped' cDNAs, we generated a representative full-length cDNA dataset for 4870 RefSeq entries, and analyzed the untranslated region (UTR) of these genes. To our surprise, about half of the 4870 genes had an upstream ATG before the ATG that starts the longest open reading frame (ORF), suggesting that about half of them have small ORFs in their UTR of average length of 31 amino acids. They require attention for further analysis to identify their biological role. To cite this article: R. Yamashita et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Résumé |
En utilisant la séquence d'ADNc obtenus par la méthode d'oligo-capping, nous avons produit un jeu de données d'ADNc de pleine longueur représentant 4870 entrées de la base RefSeq, et analysé les régions non traduites des gènes correspondants. À notre surprise, environ la moitié des 4870 gènes contiennent un codon ATG avant l'ATG, qui démarre la plus longue phase ouverte de lecture, suggérant qu'ils contiennent de courtes phases de lecture dans leur région non traduite, dont la taille moyenne est de 31 acides aminés. Elles devraient faire l'objet d'analyses attentives pour déterminer leur rôle biologique. Pour citer cet article : R. Yamashita et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Mots clés : cap ; open reading frame ; untranslated region ; transcriptional start site ; house keeping genes ; full-length cDNA.
Mots clés : coiffe ; phase ouverte de lecture ; site de demarrage de la transcription ; gènes de ménage ; ADNc de pleine longueur.
Plan
Vol 326 - N° 10-11
P. 987-991 - octobre-novembre 2003 Retour au numéro
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