High-throughput classification of images of cells transfected with cDNA clones - 01/01/03
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Résumé |
The sequence of the human genome has been determined. The next task is to determine the function of the genes. Classifying cellular forms of proteins encoded by human cDNA clones is a primary step toward understanding the biological role of proteins and their coding genes. We report here our ongoing work on an automatic system to facilitate this classification. Our system handles the transfection, incubation, acquisition of microscopic images of the cells, and the classification of forms there appearing in the images. Our system correctly classified proteins by their forms at a rate of 90% in feasibility studies. To cite this article: R. Minamikawa-Tachino et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Résumé |
Le génome humain a été séquencé. Il est désormais nécessaire d'élucider la fonction des produits des gènes exprimés. Visualiser et classifier la forme cellulaire des protéines codées par des clones d'ADNc humains constitue une première étape dans la compréhension du rôle biologique de la protéine et des gènes qui la codent. Nous décrivons le développement en cours d'un système automatique de classification d'images. Notre système englobe la transfection, l'incubation, l'acquisition d'images des cellules vues au microscope et la classification automatique de ces images. Il permet d'obtenir une classification optimale dans 90 % des études de faisabilité. Pour citer cet article : R. Minamikawa-Tachino et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Mots clés : functional genomics ; fluorescence protein ; human full length cDNA ; image processing ; protein localization ; pattern classification ; subspace method.
Mots clés : ADNc humain complet ; classification de patterns ; génomique fonctionnelle ; localisation des protéines ; méthode des sous-espaces ; protéine fluorescente ; traitement d'image.
Plan
Vol 326 - N° 10-11
P. 993-1001 - octobre-novembre 2003 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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