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In situ analysis of gene expression in Xenopus embryos - 01/01/03

Doi : 10.1016/j.crvi.2003.09.019 

Nicolas  Pollet a * ,  Hajo  Delius b ,  Christof  Niehrs c *Corresponding author. Present address: CNRS UMR 8080, IBAIC Bât 447, université Paris-Sud, 91405 Orsay, France.

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Résumé

The molecular anatomy of the vertebrate embryo was systematically analysed through gene expression during early development of the Xenopus frog using whole-mount in situ hybridization. Expression patterns are documented and assembled into the database Axeldb (http://www.dkfz-heidelberg.de/abt0135/axeldb.htm). Synexpression groups representing genes with shared, complex expression pattern that predict molecular pathways involved in patterning and differentiation have been identified. These sets of co-regulated genes show a striking similarity with operons, and may be a key determinant facilitating evolutionary change leading to animal diversity. To cite this article: N. Pollet et al., C. R. Biologies 326 (2003).

Résumé

L'anatomie moléculaire de lembryon de vertébré a été étudiée de manière systématique à travers les patrons d'expression géniques au cours du développement précoce du Xénope par hybridation in situ sur embryons entiers. Les descriptions de ces profils d'expression géniques sont documentés dans la base de données Axeldb (http://www.dkfz-heidelberg.de/abt0135/axeldb.htm). Nous avons identifié des groupes de synexpression, représentant des gènes dont l'expression complexe quasi identique prédit des voies moléculaires utilisées dans le développement et la morphogenèse. Ces groupes de gènes co-régulés sont très similaires aux opérons et pourraient être des éléments clés des changements évolutifs conduisant à la diversité du monde animal. Pour citer cet article : N. Pollet et al., C. R. Biologies 326 (2003).

Mots clés  : database ; development ; functional genomics ; gene expression ; in situ hybridization ; synexpression groups ; transcriptome ; Xenopus laevis.

Mots clés  : base de données ; développement ; expression génique ; génomique fonctionnelle ; groupes de synexpression ; hybridation in situ ; transcriptome ; Xenopus laevis.

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Vol 326 - N° 10-11

P. 1011-1017 - octobre-novembre 2003 Retour au numéro
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  • cDNAs for functional genomics and proteomics: the German Consortium
  • Stefan Wiemann, Alexander Mehrle, Stephanie Bechtel, Ruth Wellenreuther, Rainer Pepperkok, Annemarie Poustka
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  • RNA amplification, fidelity and reproducibility of expression profiling
  • Jiangning Li, Larry Adams, S.M. Schwartz, Roger E. Bumgarner

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