Les lésions anopérinéales de la maladie de Crohn sont des manifestations fréquentes, touchant près d'un malade sur deux. Le diagnostic peut s'avérer difficile lorsque la maladie luminale ne s'est pas déclarée mais, une fois posé, ces lésions permettent, par le simple examen clinique, une évaluation de l'activité de la maladie de Crohn. Les fistules, ulcérations et sténoses représentent la majorité des lésions. Du fait de leurs fréquences et des potentielles complications en abcès, les fistules restent les manifestations les plus étudiées tant sur le plan de leur description clinique et radiologique que de leur prise en charge thérapeutique. Les nouvelles techniques d'imagerie médicale, notamment l'imagerie par résonance magnétique, apportent au clinicien une aide importante pour cartographier précisément les lésions et guider la prise en charge thérapeutique. Les stratégies thérapeutiques médicales restent peu validées par les données de la littérature et les résultats sont parfois décevants. Le recours à une chirurgie périnéale qui peut mettre en jeu la continence est encore fréquent et, parfois, l'intensité des manifestations rend nécessaire la réalisation de gestes plus radicaux telle que l'amputation abdominopérinéale. Ces deux aspects de la prise en charge thérapeutique, médicale et chirurgicale, ne sont pas à opposer, mais à associer afin d'optimiser la réponse et de limiter les complications fonctionnelles anales pouvant dégrader la qualité de vie de ces malades.