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Genetic identification of Southern Ocean octopod samples using mtCOI - 06/05/10

Doi : 10.1016/j.crvi.2010.02.002 
Eivind Andreas Baste Undheim a, b, Janette Ann Norman b, Hanne Halkinrud Thoen a, b, Bryan Grieg Fry b,
a Norwegian University of Technology and Science, Department of Biology, Trondheim Biological Station, N-7491, Trondheim, Norway 
b Department of Biochemistry & Molecular Biology, Bio21 Institute, University of Melbourne, Melbourne, Victoria 3010, Australia 

Corresponding author.

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Abstract

East Antarctic octopods were identified by sequencing mtCOI and using four analytical approaches: Neighbor-joining by Kimura-2-Parameter-based distances, character-based, BLAST, and Bayesian Inference of Phylogeny. Although the distance-based analytical approaches identified a high proportion of the sequences (99.5% to genus and 88.1% to species level), these results are undermined by the absence of a clear gap between intra- and interspecific variation. The character-based approach gave highly conflicting results compared to the distance-based methods and failed to identify apomorphic characters for many of the species. While a DNA independent approach is necessary for validation of the method comparisons, crude morphological observations give early support to the distance-based results and indicate extensive range expansions of several species compared to previous studies. Furthermore, the use of distance-based phylogenetic methods nevertheless group specimens into plausible species clades that are highly useful in non-taxonomical or non-systematic studies.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Octopus, mtCOI, Pareledone, Adelieledone, Southern Ocean, Antarctica


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Vol 333 - N° 5

P. 395-404 - mai 2010 Retour au numéro
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  • Digestive cells in the midgut of Triatoma vitticeps (Stal, 1859) in different starvation periods
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