La résistance des champignons du genre Aspergillus dans le cadre du traitement médicamenteux des pathologies aspergillaires est un phénomène qui prend de l'ampleur, parallèlement à l'augmentation de l'utilisation des molécules antifongiques. Ce phénomène est complexe et fait intervenir la notion de « résistance clinique », comprenant des facteurs liés à l'hôte et aux caractéristiques pharmacologiques des molécules antifongiques, et celle de « résistance microbiologique », incluant la résistance primaire d'une espèce donnée et la résistance acquise d'isolats. Les modifications récentes de la taxonomie des Aspergillus et l'identification des mutations à l'origine de la résistance acquise d'Aspergillus fumigatus aux antifongiques azolés permettent une meilleure description de ces résistances. Elles permettent également d'envisager une meilleure prise en charge de ces pathologies même si les corrélations in vitro-in vivo sont difficiles à établir. En parallèle, ces résistances et les facteurs qui en favorisent l'acquisition devraient bénéficier de la mise en place d'une surveillance épidémiologique pour mesurer leur prévalence et leur impact.