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Gene regulation at-a-distance in E. coli: new insights - 01/01/04

Doi : 10.1016/j.crvi.2004.10.002 
Michèle Amouyal
« Interactions à distance », CNRS, 121, av. Philippe-Auguste, 75011 Paris, France 

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Abstract

The number of E. coli genes/operons regulated from sites distant from the gene, though limited, steadily increases. The regulation of the ula genes, in charge of l-ascorbate utilization, as well as the negative autoregulation of the non-related CI and 186CI repressors, for efficient switching of the corresponding phages from lysogeny to lysis, are recent examples. The interaction between the two GalR dimers, separated by 114 bp, undetectable in vitro, has been genetically mapped. lac repressor-operator loops might insulate a gene and its expression from the genomic environment. The genes in charge of nitrogen assimilation sequentially react to ammonia deprivation, via an increasing intracellular NRI concentration. Other sigma54-dependent genes are activated in response to various stimuli. To cite this article: M. Amouyal, C. R. Biologies 328 (2005).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Le nombre de gènes/opérons dʼE. coli régulés à distance du gène est restreint, mais sʼaccroît régulièrement. La régulation des gènes du régulon ula, pour lʼutilisation du l-ascorbate, ainsi que lʼautorégulation négative des répresseurs non apparentés CI et 186CI pour un déplacement efficace de la lysogénie à la lyse des phages correspondants, en font partie depuis peu. Lʼinteraction des dimères GalR à 114 pb de distance, non détectable in vitro, a été cartographiée génétiquement. Des boucles répresseur-opérateur lactose pourraient isoler lʼexpression dʼun gène des effets génomiques environnants. Les gènes responsables de lʼassimilation des composés azotés répondent en cascade à la carence en ammonium par lʼintermédiaire de concentrations croissantes en protéine NRI. Dʼautres gènes dépendant du facteur sigma54 sont activés, en réponse à divers stimuli. Pour citer cet article : M. Amouyal, C. R. Biologies 328 (2005).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : DNA looping, Action at-a-distance, Enhancers, Silencers, Oligo(multi)merization, Insulator, Barrier-element

Mots-clés : Boucle dʼADN, Action à distance, Activateurs, Silenceurs, Oligo(multi)mérisation, Séquences-barrières, Séquences isolantes


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Vol 328 - N° 1

P. 1-9 - janvier 2005 Retour au numéro
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  • Hierarchical clustering based upon contextual alignment of proteins: a different way to approach phylogeny
  • Anna Gambin, Piotr P. Slonimski

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